Agarozė ir poliakrilamidas yra vandenyje tirpūs polimerai, tačiau tarp jų galima pastebėti daug skirtumų, pradedant nuo jų kilmės. Ir agarozė, ir poliakrilamidas turi kažką bendro, sugeba sudaryti porėtos gelio matricas. Nepaisant to, tarp jų yra keletas aiškių skirtumų. Pagrindiniai abiejų šių polimerų skirtumai yra jų kilmė, cheminė struktūra, skirtingas panaudojimas ir gelinio elektroforezės veikimas..
Agarozė yra natūraliai susidaręs linijinis polimeras, kuris savo ruožtu gaunamas iš kompleksinio polimero, vadinamo agaru, esančio jūros dumbliuose. Agarozė ekstrahuojama iš agaro pašalinant jos baltymų komponentą, vadinamą agaropektinas. Agarozė suteikia agarui galimybę formuoti gelius.
Agarozė daugiausia naudojama atliekant mikrobiologinius ir molekulinius biologinius tyrimus. Mikrobiologinių tyrimų metu agarozė, papildyta tinkamomis maistinėmis medžiagomis, suteikia tvirtą pagrindą auginti mikroorganizmus, tokius kaip bakterijos ir grybeliai. Kai naudojama pusiau kieta koncentracija, ji gali būti naudinga įvertinant šių mikroorganizmų judrumą. Molekulinėje biologijoje tai yra svarbi priemonė vienam iš esminių skyrybų procesų, vadinamų 'gelio elektroforezė'arba'agarozės gelio elektroforezė'(AGE). Gelio elektroforezė yra procesas, leidžiantis išskaidyti arba atskirti nukleorūgštis ar baltymus pagal jų dydį ir krūvį. Agarozė tarnauja kaip porėtas į sietą panašus gelis, per kurį vyksta atskyrimas.
Agarozės struktūra
Poliakrilamidas yra sintetinis polimeras ir naudojamas labai įvairiose pramonės šakose. Kaip minėta anksčiau, jo naudojimas priklauso nuo gebos sudaryti gelius. Tačiau, be to, įvairiose pramonės šakose taip pat išnaudojamas jos gebėjimas sulaikyti ir nutekėti skirtingos koncentracijos vandenį.
Labiausiai paplitusi ir poliakrilamidas naudojamas nuotekų valymui. Čia jis naudojamas kaip flokuliacinis agentas pašalinant visas suspenduotas organines medžiagas; taigi, pagerina drumstumą ir praskaidrina vandenį. Kitas poliakrilamido panaudojimas naudojamas popieriaus pramonėje. Čia jis naudojamas norint išlaikyti arba nusausinti vandenį iš popieriaus plaušienos, jei reikia. Panašiai žemės ūkio ir statybų pramonėje jis naudojamas kaip dirvos gerinimo priemonė, siekiant užkirsti kelią dirvožemio erozijai ir pagerinti jo kokybę.
Kaip ir agarozė, poliakrilamidas taip pat yra naudojamas molekulinėje biologijoje kaip svarbi skiriamoji geba panašiame procese, vadinamame 'Poliakrilamido gelio elektroforezė “(PAGE). Be viso to, poliakrilamidas taip pat naudojamas rūdai perdirbti ir flokuliacinėms medžiagoms gaminti, kad būtų pašalintos visos suspenduotos organinės medžiagos; taigi, pagerina drumstumą ir praskaidrina vandenį. Kitas poliakrilamido panaudojimas naudojamas popieriaus pramonėje. Čia jis naudojamas norint išlaikyti arba nusausinti vandenį iš popieriaus plaušienos, jei reikia. Panašiai žemės ūkio ir statybų pramonėje jis naudojamas kaip dirvos gerinimo priemonė, siekiant užkirsti kelią dirvožemio erozijai ir pagerinti jo kokybę. Be viso to, poliakrilamidas taip pat naudojamas gaminant maisto priedus, minkštus kontaktinius lęšius ir tekstilę.
Poliakrilamido struktūra
Agarozė: Agarozė yra natūralios kilmės polimeras. Jis gaunamas iš jūros dumblių.
Poliakrilamidas: Poliakrilamidas yra sintetinės kilmės ir nėra randamas jokiomis natūraliomis aplinkybėmis.
Agarozė: Agarozės molekulinė formulė yra C24H38O19.
Poliakrilamidas: Poliakrilamido molekulinė formulė yra (C 3H5NE)n.
Agarozė: Agarozė yra linijinis polisacharidas. Jis yra sudarytas iš pasikartojančių disacharidų vienetų, vadinamų agrobioze, kuriuos laiko vandenilio ryšiai.
Poliakrilamidas: Poliakrilamidas yra chemiškai sujungtas polimeras. Jį sudaro akrilamido monomerai ir kryžminimo agentas N, N'-metilenbisakrilamidas.
Agarozė: Ir agarozė, ir jos monomero agrobiozė yra netoksiško pobūdžio.
Poliakrilamidas: Poliakrilamido monomerinis vienetas, akrilamidas, yra numanomas kancerogenas ir žinomas neurotoksinas, nors jo polimerizuota forma nėra toksiška..
Agarozė: Agarozės gelio paruošimas AGE yra mažiau laiko, lengvas ir paprastas, todėl jam nereikia iniciatoriaus ar polimerizuojančio katalizatoriaus.
Poliakrilamidas: Poliakrilamido gelio paruošimas PAGE yra daug laiko reikalaujantis ir varginantis procesas, taip pat reikalingas iniciatorius (amonio persulfatas) ir polimerizuojantis katalizatorius (N, N, N ', N'-tetrametiletiilendiaminas - TEMED)..
Poliakrilamido geliai yra chemiškai stabilesni nei agarozės geliai.
Atsižvelgiant į tą pačią koncentraciją, poliakrilamido gelio matricų poros yra mažesnės nei agarozės gelio matricos..
Poliakrilamido gelių porų dydį galima pakeisti labiau kontroliuojamu būdu nei agarozės gelių.
Poliakrilamido geliai turi didelę skiriamąją galią, o agarozės geliai turi mažą skiriamąją galią.
Poliakrilamido geliai skiriamąsias medžiagas gali talpinti didesniais kiekiais nukleino rūgšties nei agarozės geliai.
Vaizdai maloniai išdėstyti: agarozė ir poliakrilamido struktūra per „Wikicommons“ (viešas domenas)