Skirtumas tarp bazinio ekscizijos remonto ir nukleotidų ekscizijos remonto

Pagrindinis skirtumas - bazės ekscizijos taisymas prieš nukleotido ekscizijos taisymą
 

DNR dažnai pažeidžiama dėl įvairių vidinių ir išorinių veiksnių. Tačiau ląstelių taisymo sistemos nedelsdamos ir nuolat ištaiso pažeidimus, prieš tai virsdamos mutacijomis arba prieš perduodamos ateinančioms kartoms. Ląstelėse yra trijų tipų ekscizijos taisymo sistemos: nukleotidų ekscizijos taisymas (NER), bazės ekscizijos taisymas (BER) ir DNR neatitikimo taisymas (MMR), siekiant atitaisyti vienos grandinės DNR pažeidimus. Pagrindinis skirtumas tarp bazinės ekscizijos ir nukleotidų ekscizijos taisymo yra tas bazinės ekscizijos taisymas yra paprasta taisymo sistema, veikianti ląstelėse, siekiant atstatyti pavienius nukleotidų pažeidimus, padarytus endogeniniu būdu kol nukleotidų ekscizijos taisymas yra sudėtinga taisymo sistema, veikianti ląstelėse, kad būtų atkurti palyginti didesni, pažeisti regionai, sukelti išoriškai.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra bazinio ekscizijos remontas
3. Kas yra nukleotidų ekscizijos remontas
4. Šalutinis palyginimas - bazės ekscizijos taisymas prieš nukleotido ekscizijos taisymą
5. Santrauka

Kas yra bazinio ekscizijos remontas?

Pagrindo ekscizijos taisymas yra paprasčiausia ląstelių turima DNR taisymo sistemos versija. Jis naudojamas nedideliems DNR pažeidimams atitaisyti. DNR bazės yra modifikuotos dėl deaminacijos ar alkilinimo. Kai yra bazinių pažeidimų, DNR glikozilazė atpažįsta ir suaktyvina bazės ekscizijos atstatymo sistemą ir ją atkuria naudodama fermentus AP endonukleazę, DNR polimerazę ir DNR ligazę. Šie veiksmai yra įtraukti į BER sistemą.

1. Neteisingos ar pažeistos bazės atpažinimas ir pašalinimas DNR glikozilaze, kad būtų sukurta abazinė vieta (bazės praradimo vietos - piurininės arba apirimidinės vietos).
2. Abasinės vietos pjūvis apurinine / apirimidine endonukleazė
3. Likęs cukraus fragmentas pašalinamas lipaze arba fosfodiesteraze
4. Tarpų užpildymas DNR polimeraze
5. Slapuko užplombavimas DNR ligaze

01 pav. Pagrindo iškirpimo taisymo būdas

Kas yra nukleotidų ekscizijos remontas?

Nukleotidų ekscizijos taisymas (NER) yra svarbi ląstelių DNR ekscizijos taisymo sistema. Jis gali pataisyti ir pakeisti pažeistas sritis iki 30 bazių ilgio ir nukreipia nepažeista šablono gija. Dažni DNR pažeidimai yra daromi dėl ultravioletinės spinduliuotės, o NER apsaugo DNR, taisydama tuos pažeidimus prieš tai, kai jie tampa mutacijomis ir pereina į ateities kartas ar sukelia ligas. NER specialiai suteikia apsaugą nuo mutacijų, kurias netiesiogiai sukelia išoriniai veiksniai, tokie kaip aplinkos ir cheminiai kancerogenai. NER yra matomas beveik visuose organizmuose ir atpažįsta žalą, sukeliančią reikšmingą DNR spiralės iškraipymą.

NER procesas apima daugelio baltymų, tokių kaip XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB ir kt., Veikimą. Jis vyksta keliais supjaustymo ir įklijavimo būdais. Tie baltymai yra būtini atliekant atstatymo procesą, o vieno iš NER baltymų trūkumas yra gyvybiškai svarbus ir gali sukelti retus recesyvinius sindromus: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne sindromą (CS) ir šviesai jautrų trapių plaukų sutrikimo pavidalą. trichotiodistrofija (TTD).

02 pav. Nukleotidų iškirpimo remontas

Kuo skiriasi bazinio ekscizijos remontas nuo nukleotidų ekscizijos remonto?

Bazinio ekscizijos taisymas prieš nukleotido ekscizijos remontą
Bazinis ekscizijos taisymas (BER) yra DNR taisymo sistema, vykdoma ląstelėse.	Nukleotidų iškirpimo remontas (NER) yra dar viena DNR taisymo sistemos rūšis, randama ląstelėse.
Atpažinti DNR priedus
BER taiso žalą mažiems DNR adduktams.	NER taiso didelius DNR aduktus.
DNR pažeidimai
BER pripažįsta žalą, kuri nesukelia reikšmingų DNR spiralės iškraipymų.	NER pripažįsta žalą, kuri sukelia reikšmingą DNR spiralės iškraipymą.
DNR pažeidimų priežastys
BER pašalina endogeninių mutagenų padarytą žalą.	NER atitaiko žalą, kurią sukelia išoriniai mutagenai.
Sudėtingumas
BER yra lengviausia remonto sistema	Jis yra sudėtingesnis nei BER.
Baltymų poreikis
BER nereikia kitų baltymų.	NER reikia kelių genų produktų, ypač baltymų, kad būtų galima atskirti pažeistas ir nepažeistas sritis.
Tinkamumas
BER tinka taisyti vienos bazės pažeidimus.	NER yra tinkamas pažeistiems regionams pakeisti.

Santrauka - bazinio ekscizijos taisymas prieš nukleotido ekscizijos remontą

NER ir BER yra dviejų rūšių DNR ekscizijos atstatymo procesai, randami ląstelėse. BER geba atitaisyti nedidelius pažeidimus, padarytus endogeniniu būdu, tuo tarpu NER geba atitaisyti pažeidimo sritis, kurių ilgis yra iki 30 bazinių porų, daugiausia dėl išorinių. BER skiriasi nuo NER tuo, kad atpažįstami substratai ir pradinis skilimas. BER taip pat gali atpažinti žalą, kurios nepadarė dėl reikšmingų DNR spiralės iškraipymų, o NER atpažįsta reikšmingus DNR spiralės iškraipymus. Tai yra skirtumas tarp bazinės ir nukleotidų ekscizijos.

Vaizdo mandagumas:
1. „Dna repair base excersion en“, autorius LadyofHats - (viešas domenas) per „Commons Wikimedia“
2. „Uvr baltymų kontroliuojamo nukleotidų ekscizijos atstatymo kelio modelių schema“. Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui ir Seiki Kuramitsu. - (CC BY 1.0) per „Commons Wikimedia“

Nuorodos:
1. Kim, Yun-Jeong ir David M. Wilson. „Bazinio ekscizinio remonto biochemijos apžvalga“. Dabartinė molekulinė farmakologija. JAV nacionalinė medicinos biblioteka, 2012 m. Sausio mėn. Internetas. 2017 m. Kovo 14 d.
2. Boeras, Janas De ir Janas J. J. Hoeijmakersas. „Nukleotidų iškirpimo taisymas ir žmogaus sindromai“. Kancerogenezė. Oxford University Press, 2000 m. Kovo 1 d. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 28 d
3. Hoogstraten ir kt. „Universalus DNR pažeidimo aptikimas naudojant visuotinį genomo nukleotidų ekscizijos atstatymo baltymą XPC“. Ląstelių mokslo žurnalas. UAB „Biologai“ įmonė, 2008 m. Rugsėjo 1 d. Internetas. 2017 m. Kovo 28 d