Skirtumas tarp bukas ir lipnus pabaigos liga

Pagrindinis skirtumas - bukas vs lipnus pabaiga
 

Restrikcijos endonukleazės yra specifiniai fermentai, kurie skaido dvigrandinę DNR (dsDNR). Jie taip pat žinomi kaip molekulinės žirklės molekulinėje biologijoje. Restrikcijos fermentai sugeba atpažinti specifines trumpas dsDNR, žinomų kaip atpažinimo vietos, sekas ir skaidyti fosfodiesterio ir vandenilio ryšius, kad atsivertų dvigubos sruogos. Dėl šių fermentų skilimo susidaro DNR fragmentai su skirtingų tipų galais, tokiais kaip lipnūs ir neryškūs galai. DNR ligazė yra fermentas, naudojamas molekulinėje biologijoje sujungti dvi gretimas DNR grandines, formuojant naujus ryšius. Šis etapas yra žinomas kaip ligacija ir pagal DNR galo, kuris yra sujungtas, tipą, jie gali būti vadinami buku galu ir lipniu galu. Pagrindinis skirtumas tarp neryškaus ir lipnaus galo sujungimo yra tas tarp DNR fragmentų, turinčių du neryškius galus, įvyksta bukas galas kadangi lipnus galo sujungimas įvyksta tarp 5 'ir 3' iškyšų. Palyginus su neryškiu galo sujungimu, lipnus galo sujungimas yra efektyvesnis ir stabilus.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra „Blunt End Ligation“
3. Kas yra „Sticky End Ligation“
4. „Side by Side“ palyginimas - „Blunt vs Sticky End Ligation“
5. Santrauka

Kas yra bukas galas?

Kai kurios restrikcijos endonukleazės gali išpjauti DNR priešingose ​​bazėse ir gaminti neryškius DNR fragmentus. Šie fermentai yra žinomi kaip bukas galų pjaustytuvai; jie suskyla tiesiai iki restrikcijos vietos vidurio, nepalikdami pavienių stygų iškylančių bazių. Bukas galai taip pat žinomi kaip nepersidengiantys galai, nes jų galuose nėra 3 'ir 5' iškylančių pagrindų. Abi sruogos baigiasi iš bazinių porų neryškiais galais. Įprasti fermento pjaustymo fermentai yra „EcoRV HaeIII“, „AluI“ ir „SmaI“.

Tarp dviejų bukas galų yra sujungtas bukas galas. Tai nėra kyšančių bazių sujungimas. Šis sujungimas yra ne toks efektyvus kaip lipnus galas. Tačiau kai kuriais atvejais neryškių galų ligacija tampa naudingesnė nei lipni galo ligacija, ypač kai ligatuojami PGR produktai. PGR produktai visada gaminami su neryškiais galais. Dėl neryškių galų sujungimo DNR nereikia papildomų komplektavimo galų.

01 paveikslas: „Eco RV“ fermento nematoma produkcija

Kas yra lipni pabaigos liga?

Kai kurios restrikcijos endonukleazės sugeba išpjaustyti dsDNR, palikdamos išplatintą viengrandės DNR gabalą. Šie galai yra žinomi kaip lipnūs arba iškylantys galai. Lipnus galo sujungimas įvyksta tarp dviejų DNR fragmentų, turinčių sutampančias iškyšas, nes lipnūs galai yra su nesuporuotomis bazėmis ir, norint sudaryti jungtis, reikia papildomų bazių. Taigi abiejuose DNR šaltiniuose būtina naudoti tą patį restrikcijos fermentą, kad būtų pagaminti suderinantys ligatuojantys fragmentai.

Lipnus galo sujungimas yra efektyvesnis ir dažnai yra labai pageidautinas klonavimo procesuose. Yra keletas restrikcijos fermentų, kurie gamina lipnius galus. Tai yra EcoRI, BamHI, HindIII ir kt.

02 paveikslas: „Eco RI“ fermento lipni galutinė produkcija

Kuo skiriasi „Blunt“ ir „Sticky End Ligation“?

Blunt vs Sticky End Ligation
Tarp dviejų neryškių galų DNR fragmentų įvyksta bukas galo sujungimas.	Lipnus galų sujungimas įvyksta tarp dviejų suderinamų DNR fragmentų su lipniais galais.
Fermentai
Bukas galas pjauna galu.	Lipnių galų pjaustytuvai gamina lipnius ar rišlius galus.
Suderinamų galų reikalavimas
Tam nereikia atitikimo fragmentų ar papildomų pagrindų.	Norint sudaryti pagrindų poras, reikia, kad galuose būtų papildomos bazės.
Efektyvumas
Tai yra mažiau efektyvu nei lipnus galo sujungimas	Tai yra efektyviau nei bukas galutinis ligavimas.

Santrauka - Blunt vs Sticky End Ligation

Restrikcijos endonukleazės sugeba skaidyti dsDNR ir gaminti DNR fragmentus su skirtingais galais. Jie atpažįsta specifines sekas ir riboja DNR, sukurdami lipnius ir neryžius galus. Lipniuose galuose fragmentų gale yra nesuporuoti pagrindai. Bukas galai yra sukurti dėl tiesios skilimo ir jų galuose yra bazių poros. Lipniam galo sujungimui reikalingi du vienas kitą papildantys DNR vienetai. Tarp bet kurių dviejų neryškių galų fragmentų atsiranda bukas galo sujungimas. Tai yra skirtumas tarp nematomo ir lipnaus ligavimo.

Nuorodos:
1. Roberts, Richardas J. „Kaip restrikcijos fermentai tapo molekulinės biologijos darbiniais žirgais“. Nacionalinės mokslų akademijos leidiniai. Nacionaliniai Acad Sciences, n.d. Žiniatinklis. 2017 m. Balandžio 12 d
2. Adnanas, Amna. Ribojančių fermentų panaudojimas biotechnologijose. N.p., n.d. Žiniatinklis. 2017 m. Balandžio 12 d

Vaizdo mandagumas:
1. Ramin Herati - „EcoRV Restriction Site.rsh“ - sukurta naudojant „Inkscape“ (viešas domenas) per „Commons Wikimedia“
2. „Restrikcijos fermentas Eco RI“, autorius „Tinastella“ - savo darbas (viešas domenas) per „Commons Wikimedia“