Skirtumas tarp cDNR ir genomo bibliotekos

Pagrindinis skirtumas - cDNA vs genomo biblioteka
 

Yra du pagrindiniai DNR bibliotekų tipai, mokslininkų sukurti naudojant genų inžinerijos metodus. Tai yra cDNR biblioteka ir „Genomic“ biblioteka. pagrindinis skirtumas tarp cDNR ir „Genomic“ bibliotekos yra ta cDNR bibliotekoje yra viso organizmo mRNR klonuota komplementari DNR, o genomo DNR bibliotekoje yra viso organizmo genomo klonuoti fragmentai. Genominės DNR biblioteka yra didesnė nei cDNR biblioteka.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra cDNA biblioteka
3. Kas yra genomo biblioteka
4. Šalutinis palyginimas - cDNA vs genomo biblioteka
5. Santrauka

Kas yra genomo biblioteka?

Genominės DNR biblioteka yra klonų, turinčių viso organizmo genominės DNR fragmentus, kolekcija. Jame yra visa to organizmo genominė DNR, įskaitant kodavimo ir nekodavimo sekas. Genomo bibliotekos konstravimas atliekamas rekombinantinės DNR technologijos pagalba, po kurios atliekamas klonavimas (genų inžinerija). Kaip parodyta 01 paveiksle, yra skirtingi konstravimo etapai. Procesas prasideda nuo genomo DNR išskyrimo. Naudojant tinkamą DNR ekstrahavimo protokolą, visa organizmo genomo DNR turėtų būti išskirta. Tada DNR turėtų būti paverčiama į valdomus dydžius arba į specifinius fragmentus restrikcijos endonukleazėmis (DNR pjaustymo fermentai). Suskaidytą DNR reikia įterpti į vektorius naudojant DNR ligas (DNR jungiančius fermentus). Vektorius yra save atkartojantis organizmas. Plazmidės ir bakteriofagai yra dažniausiai naudojami vektoriai rekombinantinės DNR technologijoje. Šie surišti vektoriai yra žinomi kaip rekombinantinės DNR molekulės, nes jie turi ir savo, ir įterptos DNR sekas. Rekombinantiniai vektoriai pridedami prie bakterijos-šeimininkės ir gaminami taip, kad rekombinantiniai vektoriai galėtų absorbuoti bakterijos ląstelę. Bakterijos su rekombinantiniais vektoriais (plazmidėmis) turėtų būti auginamos auginimo terpėje. Bakterijų dauginimo metu bakterijų DNR kartu su rekombinantinėmis plazmidėmis atkartoja jų genomus ir gamina klonus. Šie klonai turi visą šaltinio organizmo genomą. Vadinasi, ji vadinama genomo biblioteka. Plazmidės gali būti lengvai atskirtos nuo bakterinės chromosomos DNR, kad būtų sukurta to organizmo genomo biblioteka. Jei tam tikrame organizme yra dominantys genai, jį lengva aptikti genomo bibliotekoje hibridizacijos būdu naudojant molekulinius zondus (žymenis)..

Genomo bibliotekos yra svarbios tiriant genomo struktūrą ir funkciją, specifinius genus, genų vietą, genų žemėlapius, mutacijas, genų seką, naujų terapinių genų identifikavimą ir kt..

Pav ._1: genomo bibliotekos sukūrimas

Kas yra cDNR biblioteka?

CDNR biblioteka yra komplementarių DNR (cDNR) klonų, sintezuotų iš visos organizmo mRNR, kolekcija. Statybos procedūra apima skirtingus veiksmus. Pirmasis žingsnis yra bendros mRNR išvalymas iš organizmo. Izoliuota mRNR paverčiama cDNR sruogomis, vadinama atvirkštine transkripcija. Atvirkštinę transkripciją palengvina fermentas, vadinamas atvirkštine transkriptaze. Jis naudoja mažą 3 'pradmenį ir inicijuoja pirmosios cDNR grandinės, papildančios šablono mRNR grandinę, sintezę. Gauta dviguba grandinė cDNR paverčiama mažesniais fragmentais, naudojant restrikcijos endonukleazes, ir įterpiama į tinkamus vektorius. Tada šios sukonstruotos rekombinantinės molekulės dedamos į organizmą-šeimininką ir auginamos auginimo terpėje, norint gauti klonus. Klonų, kuriuose yra organizmo cDNR fragmentai, kolekcija yra žinoma kaip cDNR biblioteka. Visiškai supjaustyta subrendusi mRNR neturi intronų ir reguliavimo sričių. Todėl nekoduojančių fragmentų cDNR bibliotekose nėra, kitaip nei genomo bibliotekoje.

cDNR bibliotekos yra svarbios koduojančių regionų, genų funkcijų, genų ekspresijos analizei.

2 pav. CDNR bibliotekos kūrimas

Kuo skiriasi cDNR nuo „Genomic Library“??

cDNA vs genomo biblioteka
cDNR biblioteka yra klonų, turinčių papildomą organizmo mRNR DNR, kolekcija	Genomo biblioteka yra klonų, turinčių bendrą organizmo genominę DNR, kolekcija.
Kodavimas ir nekodavimas
cDNR bibliotekoje yra tik koduojančios sekos; jame nėra intronsų.	Genomo biblioteka susideda iš visos genominės DNR, įskaitant nekoduojančią (intronus ir reguliavimo) DNR.
Dydis
cDNR biblioteka yra nedidelė.	Genomo biblioteka yra didelė.
Pradinė medžiaga
Pradinė medžiaga yra mRNR	Pradinė medžiaga yra DNR.
Atgalinės transkripcijos dalyvavimas.
Pirmosios cDNR grandinės sintezėje vyksta atvirkštinė transkripcija.	Atvirkštinė transkripcija neįvyksta.

Santrauka - cDNR ir genomo biblioteka

Genominė biblioteka parodo klonų, turinčių suskaidytą viso organizmo genominę DNR, populiaciją. cDNR biblioteka rodo klonų, turinčių viso organizmo mRNR komplementarią DNR, populiaciją. CDNR klone yra tik sekos, rastos mRNR, o genominiame klone yra viso genomo sekos. Tai yra skirtumas tarp cDNR ir genomo bibliotekos.

Nuoroda:
1. Haneefas, Deena T KochunniJazir. „Skirtumas tarp genominės ir cDNR bibliotekos“. Skirtumas tarp genominės ir cDNR bibliotekos. N.p., n.d. Žiniatinklis. 2017 m. Vasario 15 d
2. Stekelis, Dovas J., Yoavas Gitas ir Francesco Falciani. „Kelių cDNR bibliotekų genų ekspresijos palyginimas“. Genomo tyrimai. „Cold Spring Harbor Laboratory Press“, 2000 m. Gruodžio mėn. Žiniatinklis. 2017 Vasario 16
3. „Genų bibliotekos ekranai genams, susijusiems su n-butanolio tolerancija Escherichia coli“. Genų, susijusių su n-butanolio tolerancija Escherichia coli, ekranai. N.p., n.d. Žiniatinklis. 2017 Vasario 16

Vaizdo mandagumas:
1. PhD Dre'o „cDNA bibliotekos formavimas“ anglų kalbos Vikipedijoje (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“
2. Aluquette „Genominės bibliotekos kūrimas“ - Savas darbas (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“