Skirtumas tarp DNR ligazės ir DNR polimerazės

Pagrindinis skirtumas - DNR ligazė vs DNR polimerazė
 

DNR ligazė ir DNR polimerazė yra svarbūs fermentai, dalyvaujantys organizmo DNR replikacijoje ir DNR atstatymo mechanizmuose. DNR ligazė yra atsakinga už DNR fragmentų sujungimą, katalizuodama fosfodiesterinių ryšių susidarymą tarp nukleotidų. DNR polimerazė yra atsakinga už DNR sintezę iš jos statybinių blokų (nukleotidų) naudojant šabloninę DNR. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp DNR ligazės ir DNR polimerazės.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra DNR ligazė
3. Kas yra DNR polimerazė
4. Šalutinis palyginimas - DNR ligazė ir DNR polimerazė
5. Santrauka

Kas yra DNR ligazė?

DNR ligazė yra fermentas, katalizuojantis fosfodiesterinio ryšio susidarymą tarp 3 '- OH ir 5'-PO₄ nukleotidų grupes ir palengvina DNR fragmentų sujungimą. Jis taip pat žinomas kaip molekulinis dygsnis. Šis gebėjimas leidžia užpildyti DNR spragas ar spragas ir sujungti Okazaki fragmentus, susiformavusius DNR replikacijos metu. DNR ligatai yra labai naudingi rekombinantinės DNR technologijos gamyboje rekombinantinių DNR molekulių. DNR ligazė jungia dominančią DNR su vektoriaus DNR. Todėl tai yra svarbus organizmų fermentas.

DNR ligazės fermentas priklauso nuo kofaktoriaus ir Mg2⁺ jonai jo funkcijai. Yra du kofaktoriai, kurie padeda susidaryti DNR. NAD⁺ veikia kaip bakterinių DNR ligatų kofaktorius, tuo tarpu ATP dažnai veikia kaip kofaktorių viruso ir eukariotinių DNR ligas. Eukariotų DNR ligazės veikimas užbaigiamas trimis pagrindiniais etapais.

01 žingsnis. DNR ligazė užpuola ATP molekulę ir išskiria pirofosfatą (dvi fosfato grupes) ir AMP ir, formuodama ligazės-adenilato jungtį, jungiasi kovalentiškai su gautu AMP.

02 veiksmas: Susiformavęs fermento AMP tarpinis junginys perkelia AMP į 5-ojo vardo fosfatą ir suformuoja DNR - adenilatą (DNR grandinės 5'-fosfato deguonis pažeidžia tarpinį ligazės-adenilato fosforą).

03 veiksmas: DNR ligazė katalizuoja niko 3'-OH ataką ant DNR-adenilato, kad prisijungtų prie polinukleotidų ir išlaisvintų AMP.

DNR jungtys paprastai yra išskirtos iš T4 bakteriofago ir plačiai naudojamos rekombinantinės DNR technologijoje.

01 paveikslas: DNR ligazė pataisant niką

Kas yra DNR polimerazė?

DNR polimerazė yra visur esantis fermentas, esantis visuose organizmuose, dalyvaujančiuose DNR sintezėje ir genomo replikacijoje. Genetinė informacija perduodama iš tėvų į palikuonis DNR polimerazių pagalba. Tai katalizuoja naujos DNR, papildančios esamą DNR, sintezę. DNR polimerazė prideda nukleotidus (nukleorūgščių blokus) į pradmenų sekos 3 'OH grupę ir tęsia sruogų formavimą 5' kryptimi. Daugelis DNR polimerazių turi 5–3 polimerazės ir 3–5 egzonukleazės aktyvumą korektūrai..

Prokariotų DNR polimerazės aprašytos penkiose pagrindinėse grupėse. Eukariotuose yra mažiausiai 16 skirtingų DNR polimerazių. Visos šios DNR polimerazės yra suskirstytos į septynias šeimas: A, B, C, D, X, Y ir RT (atvirkštinė transkriptazė)..

02 paveikslas: DNR polimerazės sukelta DNR replikacija

Kuo skiriasi DNR ligazė ir DNR polimerazė?

DNR ligazė vs DNR polimerazė
DNR ligazė yra fermentas, katalizuojantis fosfodiesterinių ryšių susidarymą tarp nukleotidų ir jungiantis DNR fragmentus.	DNR polimerazė yra fermentas, katalizuojantis DNR sintezę, naudojant nukleotidus.
Vaidmuo DNR replikacijoje
DNR ligazė yra papildomas fermentas DNR replikacijoje, jungiantis Okazaki fragmentus.	DNR polimerazė yra pagrindinis DNR replikacijos fermentas.
Reikalavimai
Tai priklauso nuo Mg2+ jonai ir ATP / NAD+ kofaktoriai	Tai priklauso nuo šablono, nukleotidų, pradmenų ir Mg2+.
Funkcijos
DNR ligazė yra svarbi DNR rekombinacijai, DNR atstatymui ir DNR replikacijai.	DNR polimerazė yra svarbi DNR replikacijai, DNR atkūrimui ir DNR rekombinacijos technologijai.

Santrauka - DNR ligazė ir DNR polimerazė

DNR ligazė yra svarbus fermentas, reikalingas sujungti DNR fragmentus fosfodiesteriniais ryšiais. DNR polimerazė yra pagrindinis fermentas, svarbus naujos DNR sintezei. Pagrindinis skirtumas tarp DNR ligazės ir DNR polimerazės yra jų funkcija. Tačiau abu fermentai yra būtini DNR atstatymui, DNR replikacijai ir rekombinantinės DNR technologijai.

Nuoroda:
Rossi, R., A. Montecucco, G. Ciarrocchi ir G. Biamonti. „Funkcinis T4 DNR ligazės apibūdinimas: nauja įžvalga apie veikimo mechanizmą“. Branduolinių rūgščių tyrimai. JAV Nacionalinė medicinos biblioteka, 1997 m. Birželio 1 d. Internetas. 2017 m. Kovo 11 d
Martinas, Ina V. ir Stuartas A. MacNeilis. „Susisieja nuo ATP priklausoma DNR“. Genomo biologija. „BioMed Central“, 2002. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 11 d
„Garcia-Diaz“, „Miguel“ ir „Katarzyna Bebenek“. „Daugybė DNR polimerazių funkcijų.“ Kritinės augalų mokslų apžvalgos. JAV nacionalinė medicinos biblioteka, 2007 m. Kovo mėn. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 11 d

Vaizdo mandagumas:
1. „Ligase slapyvardžio taisymo mecanizmas“, autorius Jrmcnall - „ChemDraw“ (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“
2. „Phage T7 replikacijos technika“, pateikė Danykl - Savo darbas (CC BY-SA 4.0) per „Commons Wikimedia“