Skirtumas tarp FISH ir CGH

pagrindinis skirtumas tarp FISH ir CGH yra tai FISH yra molekulinė technika, kuria, naudojant fluorescenciškai pažymėtus zondus, nustatoma specifinė DNR seka chromosomoje, o CGH yra dar viena molekulinė citogenetinė technika, kuria nustatomi genomo DNR pakitimai..

Citogenetinė analizė vaidina svarbų vaidmenį medicinoje nustatant chromosomų anomalijas, tokias kaip aneuploidijos, trynimai, dubliavimosi ir pertvarkymai ir tt. Chromosomų anomalijos ilgainiui sukelia genetines ligas, tokias kaip vėžys, nevaisingumas, Dauno sindromas, Klinefelterio sindromas, Turnerio sindromas, leukemija ir kt. Aukščiau išvardytiems defektams ir ligoms nustatyti yra įvairių molekulinių citogenetinių metodų. Tarp jų, FISH (fluorescencinė in situ hibridizacija) ir CGH (lyginamoji genomo hibridizacija) yra du galingi hibridizacijos metodai. Tačiau abu metodai turi privalumų ir trūkumų.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra žuvis 
3. Kas yra CGH?
4. FISH ir CGH panašumai
5. Šalutinis palyginimas - FISH ir CGH lentelės pavidalu
6. Santrauka

Kas yra ŽUVYS?

FISH yra nukleorūgščių hibridizacijos metodas, atliekamas audinio daliai ar daliai visame audinyje ar ląstelėse. Tai yra zondu pagrįstas metodas. Metodas priklauso nuo Watsono Cricko papildomos bazės porų teorijos, todėl gaunami arba DNR - DNR hibridai, arba DNR - RNR hibridai, kurie tokiu būdu gali aptikti mutavusius genus arba identifikuoti dominantį geną. Be to, šioje technikoje naudojamos viengrandinės DNR sekos, dvigubos grandinės DNR sekos, viengrandės RNR sekos arba sintetinis oligonukleotidas, paruoštas naudojant slaptą transliaciją, kaip zondai, kurie papildo dominančias genų sekas. Be to, svarbiausias šios technikos bruožas yra zondo ženklinimas fluorescenciniais dažais. Taigi zondai jungiasi su papildomomis chromosomos dalimis ir palengvina aptikimą.

Be to, FISH yra labai jautrus ir specifinis metodas. Taigi tai yra įprasta metodika tiriant ir diagnozuojant hematologinius piktybinius navikus ir solidinius navikus. Bet FISH rodo mažą skiriamąją gebą. Norint nustatyti zondo sekas, taip pat reikia išankstinių žinių apie taikinio anomalijas.

01 paveikslas: ŽUVYS

Yra daugybė FISH taikymo sričių, daugiausia atliekant molekulinę infekcinių ligų diagnostiką, siekiant nustatyti patogenus ir patvirtinti patogeną atliekant molekulinę diagnostiką. Be to, FISH yra plačiai naudojamas metodas vystymosi biologijos, kariotipų nustatymo ir filogenetinės analizės bei chromosomų fizinio žemėlapio srityse..

Kas yra CGH?

Lyginamoji genomo hibridizacija (CGH) yra dar viena DNR pagrįsta molekulinė citogenetinė technika, kuria galima aptikti genomo DNR sekų pakitimus. Šis metodas yra pažangiausias metodas, kuriuo galima analizuoti chromosomų ir genų modifikacijas, kad būtų galima nustatyti genomo DNR sekų pokyčius ar pakitimus. Be to, CGH reikia išskirti ir suskaidyti DNR iš eksperimentinio ir etaloninio mėginio. Tada mėginiai turėtų būti paženklinti dviem skirtingais fluorescenciniais dažais (dažniausiai raudonais ir žaliaisiais). Vėliau abu mėginiai sumaišomi ir jiems leidžiama konkuruoti. Paskutinis žingsnis yra mėginių, turinčių DNR pokyčių, tokių kaip genų dubliavimasis, genų praradimas ir kt., Analizė. Ypač tai matuoja tiriamojo ir kontrolinio mėginio DNR kopijų skaičiaus skirtumus..

02 paveikslas: CGH

Dabar galima įsigyti dar vieną CGH versiją; Tai yra sudėtingesnis metodas nei įprastas CGH. Tai yra technika, vadinama masyvo pagrindu sukurtu CGH arba aCGH. aCGH leidžia tiksliai identifikuoti genų arba sekų delecijas daugybėje tūkstančių sekų viename eksperimente.

Kokie yra FISH ir CGH panašumai?

• FISH ir CGH yra du molekuliniai metodai.
• Tiek FISH, tiek CGH priklauso nuo nukleorūgščių hibridizacijos.
• Be to, abiems metodams reikia suprojektuotų zondų, kad būtų galima aptikti specifinius DNR taikinius.
• Mes naudojame juos prenataliniam ir postnataliniam genetinių ligų diagnozavimui.
• Be to, tiek FISH, tiek CGH yra labai veiksmingos priemonės genomo pakitimams tirti.
• Zondams žymėti jie naudoja fluorescencinius dažus.

Kuo skiriasi FISH ir CGH??

ŽUVYS yra savo vietoje hibridizacijos procedūra, kurios metu naudojami fluorescenciniai zondai specifinėms DNR sekoms aptikti, o CGH yra molekulinės hibridizacijos technika, nustatanti genomo DNR sekų pakitimus. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp FISH ir CGH.

Be to, FISH reikia išankstinių žinių apie taikinio anomalijas, norint suprojektuoti zondų sekas, o CGH nereikia išankstinių žinių. Taip pat papildomas skirtumas tarp FISH ir CGH yra tas, kad FISH skiriamoji geba yra ribota, o aCGH - aukšta.

Žemiau pateiktoje infografijoje apibendrinamas skirtumas tarp FISH ir CGH.

Santrauka - ŽUVYS vs CGH

FISH ir CGH yra du molekuliniai citogenetiniai metodai, palengvinantys norimų genų sekų nustatymą. FISH palengvina specifinės DNR sekos aptikimą chromosomoje, naudodamas fluorescenciškai pažymėtus zondus, o CGH palengvina genomo DNR pakitimų aptikimą. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp FISH ir CGH.

Nuoroda:

1. „Fluorescencija esant hibridizacijai (FISH)“, „Nature News“, „Nature Publishing Group“, prieinama čia.
2. Hesteris, Susan D ir kt. „Lyginamųjų genominės hibridizacijos technologijų palyginimas naudojant„ Microarray “platformas.“ Biomolekulinių metodų žurnalas: JBT, Biomolekulinių išteklių įrenginių asociacija, 2009 m. Balandžio mėn., Galima rasti čia.

Vaizdo mandagumas:

1. „Daugybinis„ ViewRNA FISH “tyrimas Jurkato ir„ HeLa “ląstelėse“. Ryan Jeffs - Savas darbas (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“
2. „CGH schema“, autorius Mbaudis (aptarimas) (įkėlimai) - nuosavas darbas (CC BY 2.5) per „Commons Wikimedia“