Skirtumas tarp pirminio ir atvirkštinio grunto

Pagrindinis skirtumas - pirmyn prieš atvirkštinį gruntą
 

Polimerazės grandininė reakcija (PGR) yra DNR amplifikacijos metodas, kuris naudojamas atliekant molekulinius biologinius reikalavimus. Tai dažniausiai naudojama technika, kuria pagaminami milijonai ar milijardai ypač dominančios DNR sekos kopijų. Tai yra in vitro metodas atliekamas laboratorijose. PGR metodas visiškai priklauso nuo komerciškai pagamintos DNR polimerazės, vadinamos Taq polimeraze. Taip pat reikia kelių kitų komponentų ir tinkamos temperatūros palaikymo. Vienas svarbus komponentas yra gruntai. Pradmenys yra trumpos DNR sekos, specialiai sukurtos taikinio DNR sekai. Paprastai jie yra maždaug 20 nukleotidų ilgio. Taq polimerazė katalizuoja nukleotidų pridėjimą į jau egzistuojančią nukleotidų seką. Taigi pradmenys yra naudojami kaip pradinis naujų gijų sintezės taškas. Taq polimerazė veikia tik 5–3 kryptimis, taigi DNR sintezė vyksta ta pačia 5–3 kryptimis. Kadangi DNR yra dviguba grandinė, PGR reikia dviejų tipų pradmenų. Jie yra žinomi kaip priekinis gruntas ir atvirkštinis gruntas. Pirmyn ir atvirkštiniai pradmenys yra vadinami grunto pailgėjimo DNR kryptimi, kai vyksta DNR sintezė.. Pirmyn pradmenis atkaitina su antisense DNR grandine ir inicijuoja + ve geno grandinės sintezę 5 '- 3' kryptimi. Grįžtamieji gruntai atkaitina jutimo grandinę ir inicijuoja koduojančiosios grandinės komplementariosios grandies sintezę; kuris yra -veda geno sruogą 5'to 3 'kryptimi. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp pirmyn ir atgal gruntai.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra „Forward Primer“
3. Kas yra atvirkštinis gruntas
4. Priekinių ir atvirkštinių pradmenų panašumai
5. Lyginimas iš šono - lentelės formos pirmyn ir atgal gruntas
6. Santrauka

Kas yra „Forward Primer“?

Orientavimas į priekį yra geno koduojančiosios ar jutimo grandinės sintezė. Taq polimerazė katalizuoja naujos grandinės sintezę 5 '- 3' kryptimi. Koduojančios grandinės sintezė įvyksta, kai gruntas atšilęs su nekoduojančia ar antisense grandine ir pailgėja 5 '- 3' kryptimi.

01 paveikslas: Pirmyn ir atgal Gruntai

Gruntas, kuris atkaitina antisense grandinę arba nekoduojančią grandinę, arba šablono grandinę, yra žinomas kaip priekinis pradmuo, nes priekinis gruntas veikia kaip atskaitos taškas koduojančios arba teigiamos geno grandinės sintezei. Pirmyn nukreiptas pradmuo turi trumpą nukleotidų seką, papildančią antisense grandinės 3 'kraštą. Jis hibridizuojasi su antisense grandine ir palengvina Taq polimerazę, kad pridėtų nukleotidus, kurie papildytų šablono grandinę.

Kas yra atvirkštinis gruntas?

Atvirkštinis pradmuo yra trumpa DNR seka, kuri atkaitinama su sensacijos grandinės arba koduojančiosios grandinės 3 'galu. Atvirkštinis gruntas tarnauja kaip atskaitos taškas sintetinant papildomą koduojančios sekos arba nekoduojančios sekos grandinę. Atvirkštinis gruntas yra suprojektuotas papildant kodavimo sruogos 3 'galą. Taigi, jis atkaitinamas su koduojančios stygos 3 'kraštu ir leidžia Taq polimerazei sintetinti antisense grandinę arba šablono grandinę. Kadangi jo orientacija yra atvirkštinė, šis gruntas yra pažymėtas kaip atvirkštinis gruntas.

Tiek atvirkštiniai, tiek priekiniai pradmenys yra svarbūs gaminant milijonus ar milijardus tam tikrų DNR regionų, kuriems yra skirta ar domina, kopijų.

Kokie yra pirminio ir atvirkštinio grunto panašumai?

• Ir pirmyn, ir atgaliniai pradmenys yra pagaminti iš oligonukleotidų.
• Ir pirmyn, ir atgaliniai pradmenys turi trumpą nukleotidų seką, papildančią DNR dvigubų sruogų šoninius kraštus.
• Tiek pirmyn, tiek atvirkštiniai pradmenys paprastai susideda iš 20 nukleotidų.
• Tiek pirmyn, tiek atvirkštiniai pradmenys naudojami polimerazės grandininėse reakcijose.
• Tiek pirmyn, tiek atvirkščiai gruntai yra sintetinami komerciškai.
• Tiek pirmyn, tiek atvirkštiniai pradmenys yra stabilūs temperatūroje ir paprastai turi panašų Tm.
• Tiek pirmyn, tiek atvirkštiniai pradmenys yra atkaitinti tikslinės DNR sekomis.
• Tiek pirmyn, tiek atvirkštiniai pradmenys yra sukurti atsižvelgiant į PGR reakcijas.
• Tiek pirmyn, tiek atvirkštiniai pradmenys yra naudojami kaip DNR amplifikacijos pradžios taškai.
• Tiek atvirkštiniai, tiek priekiniai pradmenys yra svarbūs gaminant milijonus tikslinių ar suinteresuotų DNR sekų regionų kopijų.

Kuo skiriasi pirmyn ir atvirkščiai??

Pirmyn gruntas prieš atvirkštinį gruntą
Pirmyn nukreiptas pradmuo yra trumpa DNR seka, hibridizuojanti su nekoduojančio geno 3 'galu arba šablono genų grandine ir naudojama kaip atskaitos taškas koduojančios sekos sintezei..	Atvirkštinis pradmuo yra trumpa DNR seka, hibridizuojanti su koduojančios 3 'galu arba be šablono, ir naudojama kaip atskaitos taškas nekoduojančios sekos sintezei..
Atkaitinimo kryptis
Pirmyn grunto patepimas šablono styga.	Grįžtamieji gruntai atkaitinami su netemplate styga.
Gaunama nauja seka
Pirmyn gruntas palengvina kodavimo sekos sintezę.	Atvirkštinis gruntas palengvina nekoduojančios sekos sintezę.

Santrauka - pirmyn prieš atvirkštinį gruntą

Yra dviejų tipų pradmenys, naudojami PGR technikoje. Jie yra pirmyn ir atvirkštiniai pradmenys. Remiantis pradmens pailgėjimu naujos DNR grandinės sintezėje, šie pradmenys yra pažymėti arba pavadinti. Taq polimerazė sintezuoja naująją DNR orientacija nuo 5 iki 3. Taigi gruntai yra suprojektuoti kaip papildantys dvigubų gijų 3 'galus. Pirmyn nukreiptas pradmuo, kuris pailgėja 5 '- 3' kryptimi, hibridizuojasi su antisenso 3 'galu arba šablonu ar nekoduojančia seka. Tai yra atskaitos taškas kodavimo sekos sintezei. Atvirkštinis gruntas, kuris pailgėja 5 '- 3' kryptimi, hibridizuojasi su kodavimo 3 'galu arba netemplatu, arba jutimo grandine. Tai yra atskaitos taškas nekoduojančios sekos sintezei. Tai yra skirtumas tarp pirmyn ir atgal grunto.

Nuoroda:

1. „Pradmuo (molekulinė biologija).“ Vikipedija, „Wikimedia Foundation“, 2018 m. Vasario 20 d. Galima rasti čia 
2. „Polimerazės grandininė reakcija (PGR).“ Khano akademija. Galima rasti čia 

Vaizdo mandagumas:

1.'Primers RevComp Melted2'By Richardas Wheeleris (Zephyris) - Nuosavas darbas (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“