Gelio elektroforezės ir SDS skirtumas

Pagrindinis skirtumas - gelinė elektroforezė vs SDS
 

Gelio elektroforezė yra metodas, kuriuo makromolekulės atskiriamos elektriniame lauke. Tai yra įprastas molekulinės biologijos metodas atskirti DNR, RNR ir baltymus nuo mišinių pagal jų molekulinius dydžius. SDS puslapis yra gelinės elektroforezės rūšis, naudojama baltymams atskirti nuo baltymų mišinio pagal jų dydį. Gelio elektroforezė yra terminas, naudojamas nurodyti įprastą metodą, taikomą DNR, RNR ir baltymų atskyrimui kol SDS puslapis yra vienos rūšies gelinė elektroforezė. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp gelio elektroforezės ir SDS.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra gelinė elektroforezė
3. Kas yra SDS puslapis
4. Šalutinis palyginimas - gelinė elektroforezė ir SDS puslapis
5. Santrauka

Kas yra gelio elektroforezė?

Gelio elektroforezė yra įprasta technika, naudojama laboratorijose, norint atskirti įkrautas molekules, tokias kaip DNR, RNR, baltymus ir kt., Iš jų mišinių. Gelis naudojamas gelio elektroforezėje. Jis veikia kaip molekulinis sietas. Yra du gelių tipai, naudojami gelio elektroforezėje, būtent agarozė ir poliakrilamidas. Gelio pasirinkimas ir jo paruošimas yra svarbūs veiksniai, į kuriuos reikia atsižvelgti atliekant gelio elektroforezes, nes gelio porų dydžiu reikia atsargiai manipuliuoti, kad gelio elektroforezės metu būtų galima gerai atskirti molekules. Gelio elektroforezė turi elektrinį lauką, sujungtą su dviem gelio galais. Vienas gelio galas rodo teigiamą krūvį, o kitas - neigiamai.

DNR ir RNR yra neigiamai įkrautos molekulės. Įdėję į gelį nuo neigiamo gelio galo ir pritaikę elektriniam laukui, jie pereina per gelio poras link teigiamo krūvio gelio galo. Migracijos greitis priklauso nuo krūvio ir molekulės dydžio. Mažesnės molekulės lengvai migruoja per gelio poras nei didesnės. Taigi mažesnės molekulės per gelį eina dideliu atstumu, o didesnės molekulės nukeliauja per trumpą atstumą. Norėdami stebėti molekulių judėjimą ant gelio, naudojami specialūs dažai. Elektrinis laukas veikia tam tikrą laiką ir sustabdomas, kad būtų išvengta molekulių praradimo ir būtų išlaikytos molekulės važiuojamose vietose. Gelyje galima pastebėti skirtingas juostas. Šios juostos žymi skirtingo dydžio molekules. Taigi gelio elektroforezė yra naudinga molekulėms diferencijuoti pagal jų dydį.

Gelio elektroforezė įtraukiama į įvairius metodus kaip parengiamąjį molekulinės biologijos metodą, tokius kaip PGR, RFLP, klonavimas, DNR sekos nustatymas, pietų blotinimas, genomo žemėlapių sudarymas ir kt..

01 paveikslas: Agarozės gelio elektroforezė

Kas yra SDS puslapis?

Natrio dodecilsulfato poliakrilamido gelio elektroforezė (SDS puslapis) yra gelio elektroforezės rūšis, naudojama baltymams atskirti. Kai baltymams atskirti naudojama gelinė elektroforezė, reikalingas specialus gydymas, nes baltymai nėra neigiamai įkraunami, pavyzdžiui, DNR ir RNR, ir neemigruoja link teigiamo ar neigiamo galo. Taigi prieš gelio elektroforezę baltymai denatūruojami ir padengiami neigiamu krūviu. Tai atliekama naudojant ploviklį, vadinamą natrio dodecilsulfatu (SDS). Gelio elektroforezė, kuriai palaikant naudojama terpė, naudojama SDS, ir poliakrilamido gelis, žinomas kaip SDS puslapis. Ši technika dažniausiai naudojama biochemijoje, genetikoje, kriminalistikoje ir molekulinėje biologijoje.

SDS puslapio metu baltymai maišomi su SDS. SDS išskleidžia baltymus tiesine forma ir padengia juos neigiamu krūviu, proporcingu jų molekulinei masei. Dėl neigiamo krūvio baltymų molekulės migruoja link teigiamo gelio galo ir atsiskiria pagal savo molekulinę masę. SDS puslapyje poliakrilamidas naudojamas kaip kieta gelio atrama. Faktinis baltymų atskyrimas daugiausia priklauso nuo gelio savybių. Taigi poliakrilamido gelio paruošimas turi būti kruopštus ir reikia naudoti tinkamas poliakrilamido koncentracijas. Poliakrilamido geliai pasižymi aukšta skiriamąja geba nei agarozės geliai. Taigi SDS puslapis laikomas aukštos skiriamosios gebos metodu baltymams atskirti.

SDS puslapis yra denatūravimo gelio elektroforezės tipas. Tai labai riboja baltymų analizę. Kadangi SDS denatūruoja baltymus prieš atskyrimą, tai neleidžia nustatyti fermentinio aktyvumo, baltymų jungimosi sąveikos, baltymų kofaktorių ir kt..

02 paveikslas: SDS puslapis

Kuo skiriasi gelinė elektroforezė ir SDS?

Gelio elektroforezė vs SDS
Gelio elektroforezė yra metodas, atliekamas makromolekulėms atskirti, naudojant elektrinį lauką.	SDS puslapis yra aukštos skiriamosios gebos elektroforezės metodas, naudojamas baltymams atskirti pagal jų masę.
Gelio bėgimas
Tai galima atlikti horizontaliai arba vertikaliai.	SDL puslapis visada veikia vertikaliai.
Atskyrimo pagrindas
Atskyrimas vyksta pagal krūvį ir dydį.	Baltymai atsiskiria pagal masę ir krūvį.
Rezoliucija
Agarozės gelio elektroforezė turi mažą skiriamąją gebą, o poliakrilamido gelio elektroforezė - didesnę skiriamąją gebą	SDS puslapis yra geresnės skiriamosios gebos.
Denatūracija
Gelio elektroforezė apima denatūravimo ir denatūravimo metodus.	SDS puslapis denatūruoja baltymus prieš atskyrimą.

Santrauka - gelio elektroforezė vs SDS

Gelio elektroforezė yra įprasta technika, naudojama DNR, RNR ir baltymų atskyrimui ir analizei atsižvelgiant į jų dydį ir krūvį. Yra du pagrindiniai gelinės elektroforezės tipai, būtent agarozės gelio elektroforezė ir poliakrilamido gelio elektroforezė. Agarozės geliai daugiausia naudojami nukleorūgščių atskyrimui; kai reikalinga didesnė skiriamoji geba, naudojami poliakrilamido geliai. SDS puslapis yra gelinės elektroforezės rūšis, paprastai naudojama atskirti sudėtinius baltymų mišinius. Tai laikoma aukštos skiriamosios gebos baltymų atskyrimo technika. Tai yra skirtumas tarp gelio elektroforezės ir SDS.

Nuorodos:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig ir David H. Petering. Gimtoji SDS-PAGE: Aukštos skiriamosios gebos elektroforetinis baltymų atskyrimas, išlaikant natūralias savybes, įskaitant surištus metalo jonus. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., 2014 m. Gegužė. Internetas. 2017 m. Balandžio 7 d
2. Stellwagen, Nancy C. „Elektroforezė DNR agarozės geluose, poliakrilamido geluose ir laisvajame tirpale“. Elektroforezė. JAV nacionalinė medicinos biblioteka, 2009 m. Birželio mėn. Žiniatinklis. 2017 m. Balandžio 7 d

Vaizdo mandagumas:
1. „Gelelektrophoreseapparatur“ (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“
2. „DNR agarozės gelio elektroforezė“, kurią vedė Ann Arbor gamtos išteklių mokykla - DNR laboratorija (CC BY 2.0) per „Commons Wikimedia“