Skirtumas tarp genominės DNR ir plazmidinės DNR išskyrimo

pagrindinis skirtumas tarp genominės DNR ir plazmidės DNR išskyrimo yra tai, kad genomo DNR išskyrimas yra skirtas genomo DNR ekstrakcijai, o plazmidės DNR išskyrimas - bakterijų plazmidės DNR išskyrimui..

DNR išskyrimas yra cheminis procesas, kurio metu išskiriamos DNR iš skirtingų rūšių arba iš skirtingų mėginių. DNR išskyrimas yra svarbus pasroviuose esančiose molekulinės biologijos technikose, tokiose kaip gelio elektroforezė, polimerazės grandininė reakcija ir DNR sekos nustatymo metodai. Todėl DNR išskyrimas yra svarbus cheminis procesas atliekant molekulinius biologinius tyrimus. Remiantis tyrimo tikslu, kartais reikia išskirti genominę DNR. Be to, kai kurie tyrimai sutelkia plazmidės DNR išskyrimą iš bakterijų. Genominės DNR išskyrimas yra genomo DNR išskyrimo iš prokariotinių ar eukariotinių mėginių procesas. Izoliacijos etapai skiriasi priklausomai nuo ląstelės, kurioje izoliuoja DNR, tipo. Plazmidės DNR išskyrimas yra plazmidės DNR išskyrimo iš bakterijos ląstelės procesas. Palyginti su genominės DNR izoliacija, plazmidės DNR izoliacija yra sudėtinga.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra genomo DNR izoliacija
3. Kas yra plazmidės DNR išskyrimas
4. Genominės DNR ir plazmidinės DNR išskyrimo panašumai
5. Šalutinis palyginimas - genominės DNR palyginimas su plazmidės DNR lentelės forma
6. Santrauka

Kas yra genomo DNR izoliacija?

Genominės DNR išskyrimas yra viso organizmo genomo DNR išskyrimo procesas. Šis procesas apima tris pagrindinius įvykius. Tai yra ląstelių lizė arba branduolio lizė, baltymų skaidymas arba proteolizė ir genominės DNR nusodinimas. Lizės etapas gali skirtis priklausomai nuo ląstelės tipo. Prokariotuose, nes yra peptidoglikano ląstelės siena, pirmas žingsnis turėtų būti ląstelės sienos suskaidymas. Kita vertus, eukariotuose lizės etapas apima plazminės membranos ir branduolinės membranos suskaidymą, kad būtų galima ištraukti DNR į išorę. Priešingai, augalo ir grybelio ląstelių sienelėms lizuoti būtini specialūs žingsniai.

01 paveikslas: Genominės DNR išskyrimas

Taigi, kai lizės etapas bus baigtas, DNR pateks į supernatantą. Tuo pačiu metu baltymai skaidomi tirpale ir dėl to, kad pridedama proteinazės K. Kitas žingsnis yra atskirti genomo DNR ir suskaidytus baltymus vienas nuo kito. Taigi, suskaidyti baltymai išsiskiria nusodinant, kad genomo DNR liktų supernatante. Po baltymų nusodinimo genominę DNR galima nusodinti ir pakartotinai suspenduoti tinkamame buferyje, kol to reikia eksperimentui..

Genominėje DNR, kuri yra linijinė DNR, yra visa organizmo genetinė informacija. Kitaip tariant, genomas yra gyvo organizmo paveldimumo medžiaga, atsakinga už visą struktūrinę ir funkcinę ląstelės veiklą. Jį sudaro tiek nekoduojančios, tiek nekoduojančios DNR sekos. Izoliuojant genomo DNR, jis apima visą organizmo genomą.

Kas yra plazmidės DNR išskyrimas?

Plazmidinės DNR išskyrimas yra ypatingas ir sudėtingesnis DNR išskyrimo procesas. Plazmidės yra ekstrachromosominė DNR, esanti daugumoje bakterijų ląstelių. Jie yra neaktyvi žiedinė DNR, palaikanti bakterijas išgyventi atšiauriomis aplinkos sąlygomis. Plazmidės DNR susideda iš specialių atsparių genų, kurie suteikia papildomus pranašumus bakterijoms, tokius kaip atsparumas antibiotikams, virulentiškumas ir toksiškos savybės..

02 paveikslas: Plazmidės DNR išskyrimas

Plazmidės DNR išskyrimas taip pat apima tris pagrindinius procesus; ląstelių lizė, proteinolizė ir DNR nusodinimas. Nors biocheminis izoliacijos mechanizmas yra panašus į genomo DNR išskyrimą, procesas yra sudėtingesnis. Ląstelių lizės procesas yra pats svarbiausias šios procedūros procesas. Svarbiausia, kad genomo DNR ir plazmidžių DNR neturėtų būti maišomi tarpusavyje. Todėl daug švelnesnis lizės procesas apima plazmidės DNR išskyrimo procedūrą. Taigi daugelyje plazmidžių DNR išskyrimo procedūrų naudojamas ploviklis; natrio dodecilsulfatas ląstelių lizei.

Kokie yra genominės DNR ir plazmidinės DNR išskyrimo panašumai?

• Genominės ir plazmidinės DNR išskyrimas sutelktas į organizmo DNR išgavimą.
• Be to, abu vykdo tą patį procesą, apimantį ląstelių lizę, baltymų skaidymą ir DNR nusodinimą.
• Be to, gauta abiejų procesų DNR yra svarbi tolesniems procesams.
• Be to, abu išskyrimo procesai apima DNR išgryninimo ir laikymo tam tikromis laikymo sąlygomis veiksmus.
• Be to, proteinazė K naudojama abiejuose metoduose baltymams skaidyti.

Kuo skiriasi genominė DNR ir plazmidinės DNR izoliacija??

Genominės DNR išskyrimas yra nukreiptas į visos genomo tikslinio organizmo DNR išskyrimą, tuo tarpu plazmidės DNR išskyrimas yra skirtas išskirti tik plazmidės DNR iš konkrečių bakterijų rūšių. Todėl tai yra pagrindinis skirtumas tarp genominės DNR ir plazmidės DNR išskyrimo. Be to, procedūroje yra dar vienas skirtumas tarp genominės DNR ir plazmidės DNR išskyrimo. Genomo DNR išskyrimas yra mažiau sudėtinga procedūra, palyginti su plazmidės DNR išskyrimu. Taigi, izoliuojant plazmidės DNR, būtina imtis atsargumo priemonių, kad būtų užkirstas kelias genomo ir plazmidės DNR susimaišymui..

Žemiau esanti infografinė informacija pateikia daugiau informacijos apie skirtumą tarp genominės DNR ir plazmidės DNR išskyrimo.

Santrauka - Genominės DNR ir plazmidės DNR išskyrimas

DNR išskyrimas yra svarbus molekulinės biologijos metodų procesas. Yra dviejų tipų DNR, būtent genominė DNR ir plazmidinė DNR (papildoma chromosomų DNR). Remiantis reikalavimu, kai kurios procedūros buvo vykdomos norint išskirti genominę DNR, tuo tarpu kai kurios procedūros yra skirtos išskirti tik plazmidinę DNR iš bakterijų. Taigi abiejuose procesuose dalyvaujantys veiksmai šiek tiek skiriasi vienas nuo kito. Tačiau bendras procesas abiejose izoliacijose yra vienodas. Abiejų procesų izoliuota DNR yra nepaprastai naudojama paskesniuose procesuose, tokiuose kaip klonavimas, gelio elektroforezė ir polimerazės grandininės reakcijos. Pasibaigus genomo DNR išskyrimo protokolui, visa galutinė organizmo genominė DNR gali būti išskirta kaip galutinis produktas, tuo tarpu pasibaigus plazmidės DNR išskyrimo protokolui, atitinkamos bakterijos plazmidės DNR gali būti išskirta kaip galutinis produktas. Todėl tai yra skirtumas tarp genominės DNR ir plazmidės DNR išskyrimo.

Nuoroda:

1. „DNR IŠRAŠYMAS IŠ BAKTERIJOS“. DNR ekstrahavimas iš bakterijų. Galima rasti čia 

Vaizdo mandagumas:

1. „DNR ekstrahavimas“, autorius Joo Nath - savo darbas (CC BY-SA 4.0) per „Commons Wikimedia“ 
2. „Plasmid miniprep“, autorius „Retama“ - Savas darbas, (CC BY-SA 4.0) per „Commons Wikimedia“