Genotipo ir sekvenavimo skirtumas

Pagrindinis skirtumas - Genotipų nustatymas ir sekos nustatymas
 

Genotipų nustatymas ir sekų nustatymas yra du būdai, atlikti siekiant gauti informacijos apie nukleorūgštis, daugiausia organizmo DNR. Pagrindinis genotipo ir sekos skirtumas yra tas genotipas - tai procesas, kurio metu nustatoma, kokį genetinį variantą turi individas, naudodamas žymenis, tuo tarpu sekos nustatymas yra teisingos nukleotidų sekos tam tikrame DNR fragmente nustatymas..

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra genotipas
3. Kas yra sekos
4. Šalutinis palyginimas - Genotipų sudarymas ir sekos nustatymas
5. Santrauka

Kas yra genotipas?

Genotipas - tai genetinis individo modelio nustatymas naudojant DNR ir žymenų seką ir palyginimas bei paveldėjimo identifikavimas. Genotipas yra svarbus evoliucijos biologijoje, populiacijos biologijoje, taksonomijoje, ekologijoje ir organizmų genetikoje. Tai gali būti atliekama skirtingais būdais, įskaitant DNR sekos nustatymą, polimerazės grandininę reakciją, restrikcijos fragmento ilgio polimorfizmą (RFLP), atsitiktinai amplifikuotą polimorfinį aptikimą, amplifikuoto fragmento ilgio polimorfizmą (AFLP), DNR mikrotraumus ir kt..

Genotipizavimas apima tam tikrų mažų DNR sekų fragmentų sekų sudarymą ir genetinės kompozicijos, susijusios su kitais individais, radimą naudojant genetinius žymenis. Tai nustato atskirų nukleotidų polimorfizmus (SNP) tarp asmenų arba specifinius alelius. Genotipas yra taikomas daugeliui organizmų, įskaitant žmones. Tai taip pat taikoma mikroorganizmams, tokiems kaip virusai, grybeliai ir tt, ir gali būti naudojama nustatant jų genetinius variantus su etaloniniais profiliais. Molekulinėje epidemiologijoje ir teismo mikrobiologijoje patogenų, ypač mikroorganizmų, kontrolė vykdoma pagal informaciją, gautą atlikus genotipą. Genotipas yra labai svarbus atliekant kilmės analizę. Žmonėms genotipas patvirtina motinystę ir tėvystę. Genotipas atskleis dominuojančius ir recesyvinius genų, lemiančių specifinius bruožus, alelius.

Pav ._1: RFLP genotipų nustatymas

Kas yra sekos?

Sekavimas yra teisingos nukleotido eilės nustatymo tam tikrame DNR ar RNR fragmente procesas. Beveik visa organizmo augimui ir vystymuisi reikalinga informacija yra užkoduota jo genome. Dėl kelių šimtų nukleotidų ilgių nukleorūgščių fragmentų pagaminimo ir atskyrimo būdų prieinamumo buvo sukurtos tikslios tam tikro DNR ar RNR fragmento nukleotidų sekos nustatymo procedūros. Šiandien yra įvairių tipų sekų sudarymo metodai. Šie sekų sudarymo metodai, kartu su genomo bibliotekų, reprezentuojančių visą organizmo genomą, konstravimo technologijomis, palengvina viso to organizmo genomo seką, išsamiai analizuodami genų struktūras, genų funkcijas, genų vietas, genų ekspresijas, genų žemėlapiai, genų reguliavimo regionai ir kt.

Buvo padalijami ir kartografuojami daugelio virusų, kelių bakterijų, archebakterijų, mielių ir kelių kitų organizmų genomai. Žmogaus genomo projektas leido surinkti ir suskaidyti visą žmogaus genomą ir paskelbti pirmąjį jo projektą 2003 m. Tai yra svarbus biologijos pažangos etapas. Žmogaus genomo sekos dabar naudojamos medicinos sektoriuje, siekiant nustatyti genetines retų ligų priežastis, nustatyti naujagimių ligų riziką, nustatyti įvairių vėžio genetinius duomenis, kurti naujus gydymo metodus ir kurti naujas diagnostikos priemones ir kt..

Augalų pasaulyje buvo suskirstyti ryžių ir Arabidopsis genomai. Žinios apie šias sekas neabejotinai pakeis mūsų supratimą apie ląstelių ir organizmų funkcionavimą.

Paveikslėlis_2: Sangerio sekos autoradiografas

Kuo skiriasi genotipas ir sekos?

Genotipų nustatymas ir sekos nustatymas
Genotipas - tai asmens genetinės sudėties nustatymo ir to organizmo grupės ar taksonomijos tikrinimo procesas.	Sekavimas yra tikslus tam tikros DNR ar RNR fragmento nukleotidų eilės nustatymo procesas.
Technikos
RFLP, genų sekos nustatymas, PGR, DNR mikrotraumai, AFLP ir kt.	Sanger sekos, Gilbert sekos, pirosekvensavimas, sekančios kartos sekos, šautuvo sekos ir kt..
Pagrindiniai rūpesčiai
Labiau nerimaujama dėl to, ar genotipų skirtumai lemia tikruosius fenotipų skirtumus.	Tai labiau rūpi nukleotidų tvarka ir jų skirtumai bei pokyčiai su kitais organizmais.

Santrauka - Genotipų nustatymas ir sekvenavimas

Genotipų nustatymas ir seka yra naudingi tiriant organizmų genetinę informaciją. Genotipų nustatymas - tai asmenų genotipo variacijų nustatymo ir jų kategorijų nustatymo procesas. Sekavimas yra nukleotidų teisingos sekos nustatymo suinteresuotame fragmente arba DNR srityje procesas. Abu būdai suteikia svarbios informacijos apie genus ir genomus.

Nuoroda:
1. „Genotipų sudarymo metodai“. Molekulinės biologijos metodai (Clifton, N.J.). JAV nacionalinė medicinos biblioteka, n.d. Žiniatinklis. 2017 m. Vasario 20 d.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin ir M. D. Shriver. „SNP lydymosi kreivės analizė (McSNP ): be gelio ir nebrangus požiūris į SNP genotipų nustatymą“. BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. Žiniatinklis.

Vaizdo mandagumas:
1. „RFLP genotipas“ pateikė (nežinoma) - Nacionaliniai sveikatos institutai (viešasis domenas) per „Commons Wikimedia“
2. „Radioaktyvus fluorescencinis“, autorius Abizar angliškoje Vikipedijoje (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“