Skirtumas tarp sintezės ir Taq polimerazės

Pagrindinis skirtumas - „Phusion vs Taq“ Polimerazė

DNR polimerazės yra plačiai naudojami fermentai molekulinės biologijos metoduose ir taip pat natūraliai yra visuose organizmuose, kuriuose vyksta DNR replikacija. Jie yra pagrindiniai polimerizuojantys fermentai, kurie dalyvauja replikacijos metu. DNR polimerazė yra pajėgi pridėti nukleotidus prie laisvojo DNR grandinės 3 'galo ir taip sukelti naujos grandinės išplėtimą. Šiuo metu, atsižvelgiant į molekulinės biologijos pokyčius ligų diagnostikoje ir pramonėje, svarbu gaminti įvairių naudingų savybių turinčias polimerazes. Tai padidina metodo tikslumą ir paverčia jį greitesniu metodu. Phusion ir Taq polimerazė yra du komerciškai gaminami termiškai stabilūs polimerazės fermentai, naudojami specialiose molekulinėse reikmėse. Phusion yra DNR polimerazė, išskirta iš Pyrococcus furiosus ir daugiausia naudojamas klonavimo eksperimentuose, siekiant padidinti ištikimybę. Taq DNR polimerazė yra standartinė DNR polimerazė, naudojama vykstant polimerazės grandininei reakcijai (PGR), ir ji yra išskiriama iš termiškai stabilios bakterijos; Thermus aquaticus. pagrindinis skirtumas tarp dviejų fermentų yra pirminis mikroorganizmas. Phusion yra izoliuotas nuo ekstremofilo, Pyrococcus furiosus kadangi Taq polimerazė išskiriama iš termofilo, Thermus aquaticus.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra Phusion
3. Kas yra Taq polimerazė
4. „Phusion“ ir „Taq“ polimerazių panašumai
5. Šalutinis palyginimas - „Phusion vs Taq“ polimerazė lentelės pavidalu
6. Santrauka

Kas yra Phusion?

Branduolio DNR polimerazė yra nauja polimerazė, gaunama izoliuojant fermentą iš Pyrococcus furiosus, kuri yra ekstremofilinė Archaea. Šie mikrobai gyvena ypač aukštoje temperatūroje, todėl polimerazė yra labai stabili šilumos atžvilgiu. Phusion polimerazė yra naudojama siekiant išgauti ištikimybę palyginti su įprasta termostabilia polimeraze; Taq polimerazė. Branduolio polimerazė sugeba amplifikuoti ilgus, iki 7,5 kb genominės DNR šablonus. Optimali sintezės polimerazės polimerizacijos talpa yra 72⁰C. Phusion taip pat naudojamas klonavimo produktuose sekvenavimui, ekspresijos analizei ir mutacijų analizei.

Branduolio sintezės DNR polimerazė turi 3 '- 5' egzonukleazės aktyvumą. Tai leidžia koreguoti naujai susintetintą giją po sintezės. Taigi, nukleotidų neatitikimai lengvai ištaisomi. Taigi, jis turi mažesnį klaidų lygį. Bendrieji sintezės polimerazės pranašumai yra;

Nepaprasta ištikimybė
Didelis greitis ir sutrumpintas pratęsimo laikas
Tvirtos reakcijos ir reikalauja minimalios optimizacijos
Didelis derlius

01 paveikslas: Phusion

Pagrindinis Phusion polimerazės trūkumas yra tai, kad ji slopinama esant deoksiuridino trifosfatui (dUTP). Kai dUTP kaupiasi reakcijos mišinyje, tai gali slopinti sintezės polimerazės veiksmus. Tai užkertamas kelias prieš pridedant fermento, reakcijos mišinį apdorojant dUTPaze. Šiuo metu vietoj sintezės polimerazės kaip šios problemos sprendimo būdas naudojamas dUTP atsparus sintezės polimerazės variantas, žinomas kaip Pfu Turbo..

Kas yra Taq polimerazė?

Taq DNR polimerazė išradimas sukėlė revoliuciją molekulinės biologijos srityje. Tai išsprendė didelę DNR amplifikacijos problemą. Taq DNR polimerazė yra termiškai stabilus polimerazės fermentas, išgaunamas ir išskirtas iš termofilinės bakterijos, Thermus aquaticus. Šio fermento atradimas lemia PGR vystymąsi. Šis fermentas leido naudoti DNR amplifikacijoje polimerazės grandininę reakciją, o ne įprastus varginančius klonavimo metodus. PGR dabar naudojama molekulinėje diagnostikoje, žemės ūkio ir pramonės srityse, o technikai pridedama daug naujų variantų.

02 paveikslas: Taq polimerazė

Taq DNR polimerazė veikia optimalioje temperatūros intervale nuo 72 ° C⁰C - 80⁰C. Taq DNR polimerazei reikia koeficiento; magnis savo funkcijai. Taq polimerazė neturi 3 '- 5' korektūros galimybių, todėl Taq DNR polimerazės klaidų lygis yra didelis, palyginti su naujesnių rūšių DNR polimerazėmis, tokiomis kaip fusijos polimerazė ir kt., Tačiau Taq DNR polimerazės populiarumas išlieka dėl fermento patogumo ir lankstumo tas pats visame mokslo pasaulyje.

Kokie yra „Phusion“ ir „Taq“ polimerazių panašumai?

Tiek „Phusion“, tiek ir „Taq“ polimerazės fermentai yra polimerizuojantys fermentai, galintys pridėti nukleotidus prie 3 'laisvo DNR grandinės galo.
Tiek Phusion, tiek Taq polimerazėms reikia pradmenų sekos, kad būtų galima inicijuoti polimerizaciją.
Phusion ir Taq polimerazės yra stabilios šilumai.
Tiek Phusion, tiek Taq polimerazės yra naudojamos PGR mechanizmuose, norint amplifikuoti DNR.
Į reakcijos mišinį pridedant polimerazės, tiek Phusion, tiek Taq polimerazės pridedamos paskutinės, kad būtų užtikrintas fermento efektyvumas..
Phusion ir Taq polimerazės yra komerciškai sintetinamos molekulinės biologijos eksperimentiniais tikslais.
Tiek Phusion, tiek Taq polimerazėms reikalingas kofaktorius, kad atliktų savo funkcijas.

Kuo skiriasi „Phusion“ ir „Taq“ polimerazės?

„Phusion vs Taq“ polimerazė
Phusion yra DNR polimerazė, išskirta iš Pyrococcus furiosus ir daugiausia naudojamas klonavimo eksperimentuose, siekiant padidinti ištikimybę.	Taq DNR polimerazė yra standartinė DNR polimerazė, naudojama vykstant polimerazės grandininei reakcijai (PGR), ir ji yra išskiriama iš termiškai stabilios bakterijos, Thermus aquaticus.
Šaltinis Organizmas
Fuzija išgaunama iš ekstremofilinės archajos - Pyrococcus furiosus.	Šie literatūros kūriniai trunka nuo kolonizacijos laikotarpio iki dekolonizacijos laikotarpio.
Gebėjimas įrodyti
„Phusion“ turi 3–5 skaitinių duomenų skaitymo galimybę.	Taq polimerazėje trūksta 3–5 skaitinių skaitinių duomenų.
ištikimybė
„Phusion“ yra ištikimas.	Taq polimerazė rodo mažą ištikimybę.
Amplifikacija
Phusion sugeba amplifikuoti ilgus DNR fragmentus.	Taq polimerazė sugeba amplifikuoti daug trumpesnius DNR fragmentus.
dUTP apsinuodijimas
Branduolio sintezę slopina kaupimosi nelygumai.	DUPT neslopina Taq polimerazės.

Santrauka - „Phusion vs Taq“ polimerazė

Branduolių sintezė ir Taq DNR polimerazės yra dvi termiškai stabilios polimerazės, kurios naudojamos PGR metoduose. Phusion yra polimerazė, išskirta iš ekstremofilo, Pyrococcus furiosus kadangi Taq yra izoliuotas nuo termostabilių bakterijų Thermus aquaticus. Taq DNR polimerazės atradimas lemia PGR išradimą. „Phusion“ turi daug pranašumų, palyginti su „Taq“, todėl „Phusion“ tapo geresniu variantu gaminant didelio tikslumo DNR. Tačiau Taq polimerazė vis dar naudojama kaip standartinis polimerazės fermentas PGR. Tai yra skirtumas tarp Phusion ir Taq polimerazių.

Nuoroda:

1.Biolabsas, Naujoji Anglija. „Taq DNR polimerazės“. Naujosios Anglijos biolaukai: reagentai gyvybės mokslų pramonei. Galima rasti čia
2. „Branduolio sintezės DNR polimerazė“. Naujosios Anglijos biolabs. Galima rasti čia

Vaizdo mandagumas:

1.GAM iliustruotas Nivin Nasri'By NivinN - Nuosavas darbas, (CC BY-SA 4.0) per „Commons Wikimedia“
2.'Taq'By Adenosine - Nuosavas darbas, (CC BY-SA 3.0) per Commons Wikimedia

Mokslas ir gamta