Skirtumas tarp VNTR ir STR

Pagrindinis skirtumas - VNTR vs STR
 

DNR tyrimai yra nepaprastai naudingi suprantant ir nustatant filogenetinius ryšius, diagnozuojant genetines ligas ir kartojant organizmo genomus. Tam tikras genas arba DNR seka nežinomų DNR telkinyje identifikuojami naudojant keletą metodų, susijusių su DNR analize. Jie yra žinomi kaip genetiniai žymenys. Genetiniai žymekliai naudojami molekulinėje biologijoje siekiant nustatyti genetinius individų ir rūšių pokyčius. Kintamo skaičiaus tandemo kartojimas (VNTR) ir trumpas tandemo kartojimas (STR) yra dviejų tipų genetiniai žymenys, parodantys asmenų polimorfizmą. Abu tipai yra nekoduojami pasikartojantys DNR, kurie kartojasi kartu. Jie yra išdėstyti chromosomose nuo galvos iki uodegos. VNTR yra genomo atkarpa, kurioje trumpa nukleotidų seka pakartojama kelis kartus. STR yra dar viena genomo DNR dalis, kuri šimtus kartų yra organizuota kaip pasikartojantys vienetai, susidedantys iš nuo dviejų iki trylikos nukleotidų. Pagrindinis skirtumas tarp VNTR ir STR yra nukleotidų skaičius pasikartojančioje seka. Pasikartojančius VNTR vienetus sudaro nuo 10 iki 100 nukleotidų, o pasikartojančius STR vienetus sudaro nuo 2 iki 13 nukleotidų. VNTR ir STR yra plačiai naudojami kriminalistikos tyrimuose.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra VNTR 
3. Kas yra STR
4. VNTR ir STR panašumai
5. Lyginimas iš šono - lentelės formos VNTR vs STR
6. Santrauka

Kas yra VNTR?

Tandemo kartojimas yra trumpa DNR seka, kuri kartojama nuo galvos iki uodegos tam tikrame chromosomų lokuse. Tandemo kartojime nėra jokios kitos sekos ar nukleotido. Genome yra keletas tandemo pakartojimų tipų. VNTR yra tarp jų esantis tandemo kartojimo tipas, turintis pasikartojančius vienetus, sudarytus nuo 10 iki 100 nukleotidų. VNTR yra minisatellito rūšis. Šie tandemo pakartojimai gali būti randami daugelyje chromosomų. Jie yra įsiterpę į žmogaus genomą ir daugiausia yra chromosomų subtelomeriniuose regionuose..

 VNTR rodo tandemą, kuris kartoja žmonių polimorfizmą. VNTR ilgis tam tikroje chromosomos vietoje labai kinta tarp asmenų dėl to, kad pasikartojančių vienetų, organizuotų toje DNR sekcijoje, skaičius skiriasi. Todėl VNTR gali būti naudojamas kaip galinga priemonė identifikuojant asmenis, o VNTR analizė naudojama daugelyje sričių, įskaitant genetiką, biologijos tyrimus, kriminalistiką ir DNR pirštų atspaudus. VNTR buvo pirmieji genetiniai žymenys, naudojami kiekybiškai įvertinti kaulų čiulpų persodinimo transplantaciją. VNTR taip pat buvo pirmieji polimorfiniai žymenys, naudojami atliekant DNR profiliavimą kriminalistikoje.

01 paveikslas. Šešių asmenų VNTR kitimas

VNTR analizė atliekama restrikcijos fragmento ilgio polimorfizmu, po kurio eina pietinė hibridizacija. Taigi jai reikia palyginti didelio DNR mėginio. VNTR profilio aiškinimas taip pat yra problemiškas. Dėl šių apribojimų VNTR naudojimas teismo genetikoje buvo ribotas ir jis pakeistas STR analize.

Kas yra STR?

STR yra labai pasikartojanti DNR sekcija, susidedanti iš dviejų iki trylikos nukleotidų kartojančių vienetų, organizuotų tandemu. STR yra panašus į VNTR. Bet tai skiriasi nuo VNTR nuo nukleotidų skaičiaus pasikartojančioje seka ir pakartojimų skaičiaus. STR yra mikrosatellito rūšis.

Tiksli pasikartojančių vienetų skaičiaus matavimas - STR analizė. STR labai skiriasi tarp asmenų, panašiai kaip VNT. STR profiliai skirtingiems žmonėms skiriasi. Todėl, norint palyginti specifinius dviejų ar daugiau mėginių DNR lokusus, molekulinėje biologijoje naudojama STR analizė. Taigi STR yra laikomi galingais genetiniais žymenimis molekulinėje biologijoje. Tai yra puikus įrankis identifikuoti asmenis dėl jų didelio polimorfizmo laipsnio ir palyginti trumpo ilgio.

Šiuo metu teismo ekspertizėje genetiniai polimorfizmo įrankiai yra dažniausiai naudojami analizuojami STR. Daugelyje teismo medicinos bylų yra atliekama STR polimorfinė analizė. STR lokusai pasklidę visame genome. Chromosomose yra tūkstančiai STR, kurie gali būti naudojami atliekant teismo analizę. STR analizė neapima restrikcijos ilgio polimorfizmo, kaip VNTR analizė. STR analizė neskaldo DNR su restrikcijos fermentais. Tam tikri zondai yra naudojami norimoms sritims pritvirtinti prie DNR ir, naudojant PGR metodą, nustatomi STR ilgiai.

02 paveikslas: STR variacija tarp mėginių

Kokie yra VNTR ir STR panašumai??

• VNTR ir STR yra nekoduojanti DNR.
• Abu yra tandemo pakartojimai.
• Jie abu parodo polimorfizmą tarp asmenų dėl skirtingo DNR sekcijos ilgio.
• Abu jie naudojami kaip galingi genetiniai žymekliai tiriant DNR pirštų atspaudus ir atliekant teismo ekspertizę.

Kuo skiriasi VNTR ir STR?

VNTR vs STR
VNTR yra nekoduojama pasikartojanti DNR, turinti trumpą nukleotidų seką, pakartotą tandemu.	STR yra labai pasikartojanti DNR sekcija, susidedanti iš dviejų iki trylikos nukleotidų kartojančių vienetų, organizuotų tandemu..
Dydis
VNTR yra didesni nei STR.	STR yra mažesni nei VNTR.
Nukleotidų skaičius kartojant seką
Kartojantis VNTR vienetas susideda iš 10–100 nukleotidų.	Kartojantis STR vienetas susideda iš 2–13 nukleotidų.

Santrauka - VNTR vs STR

VNTR ir STR yra du galingi genetiniai žymenys, naudojami molekulinėje biologijoje, ypač teismo genetikos srityje. VNTR yra minisatellite tipas, o STR yra mikrosatellite. VNTR ir STR yra nekoduojama, labai pasikartojanti DNR. Jie kartojasi kartu. Bendroji VNTR ir STR struktūra yra vienoda. Tačiau kartojančios sekos nukleotidų skaičius ir ilgis skiriasi. VNTR turi pasikartojančias sekas, kurias sudaro nuo 10 iki 100 nukleotidų. STR turi pasikartojančias sekas, susidedančias iš 2–13 nukleotidų. Tai yra skirtumas tarp VNTR ir STR.

Atsisiųsti „VNTR vs STR“ PDF versiją

Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungę prie nuorodų. Atsisiųskite PDF versiją čia. Skirtumas tarp VNTR ir STR.

Nuorodos:

1. „Teismo medicinos genetikos mokslas“. CRG - Atsakingos genetikos taryba. N.p., n.d. Žiniatinklis. Galima rasti čia. 2017 m. Liepos 10 d.
2. „STR analizė“. Vikipedija. „Wikimedia Foundation“, 2017 m. Kovo 22 d. Žiniatinklis. Galima rasti čia. 2017 m. Liepos 10 d.

Vaizdo mandagumas:

1. „D1S80Demo“ - „PaleWhaleGail“ anglų kalbos Vikipedijoje (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“