DNR klonavimas yra svarbus procesas, leidžiantis skleisti svarbius organizmų DNR fragmentus. Norint sukurti rekombinantinę DNR, kuri virsta organizmu šeimininku, reikia sujungti specifinę DNR su vektoriaus DNR. Vektorius yra DNR molekulė, veikianti kaip nešiklis svetimoms genetinėms medžiagoms pernešti į kitą ląstelę ar organizmą. Jis turėtų sugebėti daugintis organizmo šeimininko viduje ir gaminti daugybę rekombinantinės DNR kopijų. DNR klonavimui naudojami skirtingi vektoriai. Mielių dirbtinė chromosoma (YAC) ir M13 fagų vektorius yra dvi rūšys. Pagrindinis skirtumas tarp YAC ir M13 fagų vektorių yra tas YAC yra dirbtinė chromosoma, kuri dauginasi mielių ląstelėse kol M13 fago vektorius yra viengrandis žiedinis M13 bakteriofago DNR, kuris dauginasi E Coli ląstelės.
TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra YAC?
3. Kas yra M13 fago vektorius
4. Šalutinis palyginimas - „YAC vs M13 Phage Vector“
5. Santrauka
YAC yra dirbtinai sukurta chromosoma, turinti galimybę pernešti didelį svetimos DNR segmentą ir replikuoti mielių ląstelėse. Jis turi centromerą, telomerą ir autonomiškai besikartojančias sekas, būtinas replikacijai ir stabilumui. YAC taip pat turėtų turėti selektyvųjį žymeklį arba žymenis ir restrikcijos vietas, kad jis būtų efektyvus klonavimo vektorius. Didelės sekos nuo 1000 kb iki 2000 kb gali būti įterptos į YAC ir pernešamos į mieles.
01 paveikslas: YAC vektorius
Bakteriofagas M13 yra virusas, kuris užkrečia ir dauginasi E Coli. M13 bakteriofago genomas yra mažo dydžio, apie 6,7 kb. Tai yra vienos grandinės, apskrito ir teigiamo pojūčio DNR. Šis virusas specialiai užkrečia E Coli bakterijos per F pilį. Patekusi į ssDNR į bakteriją, ji susintetina savo papildomą grandinę ir tampa dsDNR arba M13 replikacine forma (RF). RF gali elgtis kaip plazmidė šeimininko organizme. DsDNA atkartoja viduje E Coli ir gamina ssDNR, turinčius naujus fagus. Šie nauji fagai yra nuolat išleidžiami iš E Coli nenužudydamas šeimininko ląstelės. Tačiau infekcija sulėtina E Coli augimą. dsDNR gali būti išgaunama iš bakterijų ląstelių ir naudojama kaip vektoriai DNR klonuojant. Jie yra žinomi kaip M13 fagų vektoriai. Jie gali būti lengvai manipuliuojami ir naudojami panašiai kaip plazmidžių vektoriai.
Įgimtas šių M13 fagų užkrėtimo gebėjimas yra tinkama kvalifikacija, kad jis būtų naudojamas kaip vektorius genų klonavimui. Kuriant M13 į vektorių, į jo genomą turėtų būti įtraukti keli elementai. Jie yra lac repressor (lac I) baltymo genas, proksimalinis operatoriaus regionas lac Z genas, lac promotorius ir daugybinė klonavimo vieta (polilinkeris). Kai M13 dsDNR naudojama kaip vektoriai, ji gali būti traktuojama kaip plazmidės vektorius. Tačiau ssDNR M13 naudojimas turi pranašumų atliekant DNR seką ir nukreipiant į vietą nukreiptą mutagenezę.
Kadangi M13 fago vektorius turi daugybę klonavimo vietų LacZ regione rekombinuoti vektoriai gali būti lengvai atpažįstami mėlynos / baltos kolonijos atrankos būdu agaro lėkštelėse, turinčiose IPTG ir X-Gal. Plokštelėse susidariusiose mėlynose plokštelėse nėra rekombinuotų fagų. Todėl klonavimo tikslu galima pasirinkti fagus su įdėklais.
02 paveikslas: M13 bakteriofagas
YAC vs M13 fagų vektorius | |
YAC yra genetiškai modifikuota chromosoma, turinti galimybę pernešti didelį svetimos DNR segmentą ir replikuoti mielių ląstelėse. | M13 fagų vektorius yra virusinis vektorius, kurį sukūrė bakteriofagas M13, kuris naudojamas įterpti svetimą DNR E Coli. |
Tikslas | |
YAC buvo sukurti dideliems genominės DNR fragmentams klonuoti į mieles. | M13 fagų vektoriai yra naudojami įterpti svetimą DNR E Coli. |
Įterpti ilgį | |
YAC gali būti megabazės dydžio genominiai intarpai (1000 kb - 2000 kb). | Įdėklų dydis yra apie 1500 bps. |
Statyba | |
YAC DNR sunku išvalyti nepažeistą, todėl YAC vektorių sistemai sukurti reikia didelės koncentracijos. | Jis atsiranda per ciklinę fotosintetinę elektronų grandinę. |
Stabilumas | |
YAC yra nestabilus. | M13 fagus galima lengvai išgauti. |
Dydis | |
Fermentai yra didesnės molekulės. | M13 fagai yra stabilūs nei YAC. |
YAC yra dirbtinai sukonstruota vektorių sistema, naudojant tam tikrą mielių chromosomos sritį, į mielių ląsteles įdedant didelius genetinės medžiagos segmentus. M13 fago vektorius yra vektorių sistema, gauta iš bakteriofago M 13, naudojanti E coli kaip organizmas-šeimininkas. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp YAC ir M13 Phage Vector. Abi yra vienodai naudingos rekombinantinės DNR technologijos ir genų klonavimo srityse.
Nuoroda:
1. „Vektorius“. Genetika-užrašai - vektorius. N.p., n.d. Žiniatinklis. 2017 m. Gegužės 16 d. Https://genetics-notes.wikispaces.com/Vektorius
2. „Mielių dirbtinė chromosoma“. Vikipedija. „Wikimedia Foundation“, 2017 m. Balandžio 21 d. Žiniatinklis. 2017 m. Gegužės 16 d. .
Vaizdo mandagumas:
1. „M13B“ pateikė J3D3 - Savo darbas (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“