Skirtumas tarp ėjimo į chromosomą ir šokinėjimo

Pagrindinis skirtumas - vaikščiojimas su chromosoma vs šokinėjimas
 

Chromosomos ėjimas ir chromosomų šokinėjimas yra dvi techninės priemonės, naudojamos molekulinėje biologijoje, norint nustatyti genus ant chromosomų ir fiziškai kartoti genomus. Chromosomos ėjimas yra metodas, naudojamas tikslinio geno klonavimui genomo bibliotekoje, pakartotinai išskiriant ir klonuojant gretimus genomo bibliotekos klonus.. Chromosomų šokinėjimas yra speciali chromosomų vaikščiojimo versija, įveikianti chromosomų vaikščiojimo ribas. Chromosominis ėjimas gali sekti ir atvaizduoti tik mažą chromosomų ilgį, tuo tarpu chromosomų šokinėjimas leidžia sekti dideles chromosomų dalis. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp chromosomų vaikščiojimo ir chromosomų šokinėjimo.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra vaikščiojimas chromosoma
3. Kas yra chromosomų šokinėjimas
4. Šalutinis palyginimas - vaikščiojimas su chromosoma ir šokinėja
5. Santrauka

Kas yra vaikščiojimas chromosoma?

Chromosomos ėjimas yra įrankis, tiriantis nežinomas chromosomų sekų sritis, naudojant persidengiančius restrikcijos fragmentus. Vaikščiojant chromosoma, žinomo geno dalis naudojama kaip zondas ir toliau apibūdinama visa chromosomos ilgis, kurį reikia nustatyti arba nustatyti. Tai eina nuo žymeklio iki tikslo ilgio. Vaikščiojant chromosoma, kiekvieno sutampančio fragmento galai naudojami hibridizacijai, norint nustatyti sekančią seką.

Zondai yra paruošti iš galinių klonuotų DNR gabalų ir subklonuojami. Tada jie naudojami kitam persidengiančiam fragmentui surasti. Visos šios sutampančios sekos naudojamos sudarant genetinį chromosomos žemėlapį ir nustatant taikinius genus. Tai ilgų DNR ruožų analizės metodas, atliekant nedidelius persidengiančius fragmentus iš rekonstruotos genomo bibliotekos.

Chromosomos ėjimo technika - žingsniai

1. DNR fragmento, turinčio žinomą geną arba žymeklį, išsiskyrimas šalia tikslinio geno

2. Pasirinkto fragmento restrikcijos žemėlapio paruošimas ir fragmento galinės srities subklonavimas, kad būtų naudojamas kaip zondas
3. Zondo hibridizavimas su kitu persidengiančiu fragmentu
4. 1 fragmento restrikcijos žemėlapio paruošimas ir 1 fragmento galinės srities subklonavimas, kad būtų naudojamas kaip zondas kito sutampančio fragmento identifikavimui.
5. Zondo hibridizavimas su kitu persidengiančiu 2 fragmentu

6. 2 fragmento restrikcijos žemėlapio paruošimas ir 2 fragmento galinės srities subklonavimas, kad būtų naudojamas zondas identifikuoti kitą persidengiantį fragmentą

Aukščiau nurodytus veiksmus reikia tęsti iki tikslinio geno arba iki viso sekos ilgio 3 'pabaigos.

01 paveikslas: Chromosomos ėjimo technika

Ėjimas chromosomomis yra svarbus citogenetikos aspektas ieškant daugelio organizmų SNP ir analizuojant genetiškai perduodamas ligas bei nustatant atitinkamų genų mutacijas.

Kas yra chromosomų šokinėjimas?

Chromosomų šokinėjimas yra metodas, naudojamas molekulinėje biologijoje fiziniam organizmų genomų kartografavimui. Ši technika buvo įdiegta siekiant įveikti chromosomų vaikščiojimo barjerą, atsirandantį klojant aptikti pasikartojančias DNR sritis. Todėl chromosomų šokinėjimo techniką galima laikyti specialia chromosomų ėjimo versija. Tai greitas metodas, palyginti su chromosominiu ėjimu, ir leidžia apeiti pasikartojančias DNR sekas, kurios nėra linkusios klonuoti einant chromosomomis. Chromosomų šokinėjimas sumažina atotrūkį tarp taikinio geno ir turimų žinomų žymenų genomo žemėlapiams nustatyti.

Chromosomos šuolio įrankis prasideda specifinės DNR išpjaustymu su specialiomis restrikcijos endonukleazėmis ir fragmentų sujungimu į žiedines kilpas. Tada iš žinomos sekos suprojektuotas gruntas yra naudojamas žiedinių žiedų sekoms sekti. Šis gruntas suteikia galimybę šokinėti ir sekti alternatyviu būdu. Taigi jis gali apeiti pasikartojančias DNR sekas ir greitai pereiti chromosomą ieškodamas tikslinio geno.

Cistinės fibrozės ligos kodo geno atradimas buvo atliktas naudojant chromosomų šokinėjimo įrankį. Derinant kartu, chromosomų šokinėjimas ir ėjimas gali sustiprinti genomo žemėlapio sudarymo procesą.

02 paveikslas: Chromosomos šokinėjimas

Kuo skiriasi vaikščiojimas nuo chromosomos ir šokinėjimo?

Chromosomos ėjimas prieš šokinėjimą
Chromosoma yra priemonė, naudojama molekulinėje biologijoje genomo žemėlapiams nustatyti ir konkretiems genams nustatyti.	Chromosomų šokinėjimas yra įrankis, naudojamas fiziniam genomų žemėlapiams ir greitam taikinių genų suradimui chromosomose.
Palyginamieji sekų ilgiai
Tik mažus fragmentus galima klonuoti einant chromosomomis.	Didesnį chromosomų ilgį galima susieti su chromosomų šokinėjimu.
Kartojančios DNR klonavimas chromosomose
Chromosomos vaikščiojimo technikai sunku vaikščioti pasikartojančiomis DNR sekomis, esančiomis chromosomose.	Tai leidžia apeiti pasikartojančias DNR sekas. Todėl sekant juos rasti nėra sunku.
Veiksniai, veikiantys procesus
Proceso sėkmė priklauso nuo genomo dydžio ir atstumo, kurį reikia „nueiti“ nuo žinomos genomo padėties link norimo geno..	Sėkmė nepriklauso nuo atstumo nuo žymeklio iki taikinio genomo dydžio.
Klonuotų DNR poveikis
Chromosomų vaikščiojimą gali sustabdyti neklonuoti DNR fragmentai.	Mažiausia natų piknikai, kuriuos galima žaisti, yra D4.
Žinomos sekos poreikis
Procesas prasideda žinomu genu, esančiu netoli taikinio.	Tam reikalingas žinomas grunto projektavimas.

Santrauka - Ėjimas Chromosomos vs šokinėjimas

Chromosominis ėjimas dažnai taikomas, kai yra žinoma, kad tam tikras genas yra šalia anksčiau klonuoto geno chromosomoje, ir jį galima identifikuoti pakartotinai išskiriant gretimus genominius klonus iš genomo bibliotekos. Tačiau, kai atliekant chromosomų ėjimo metodiką randama pasikartojančių DNR sričių, proceso negalima tęsti. Taigi technika nuo to momento nutrūksta. Chromosomų šokinėjimas yra molekulinė biologinė priemonė, kuri įveikia šį genomų žemėlapio apribojimą. Tai apeina šias pasikartojančias DNR sritis, kurias sunku klonuoti, ir padeda fiziškai kartoti genomus. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp chromosomų ėjimo ir šokinėjimo.

Nuorodos:
1. Nakaseko, Jukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa ir Mitsuhiro Yanagida. „Chromosomos ėjimas rodo labai homologišką pasikartojančią seką, esančią visuose centromerų regionuose, dalijamosiose mielėse.“ EMBO žurnalas. JAV nacionalinė medicinos biblioteka, 1986 m. Gegužė. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 22 d
2. Taheri, Ali. „Chromosomos ėjimas ir šokinėjimas“. Genetinės inžinerijos pasiekimai. „OMICS International“, 2013 m. Spalio 30 d. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 22 d