Skirtumas tarp klonų klonavimo ir šaudymo pistoletų sekos nustatymo

pagrindinis skirtumas Tarp klono sekos nustatymo ir šautuvo sekos nustatymo slypi jų elgesio metodas. Klonas naudojant klono sekos nustatymo metodą apima chromosomų žemėlapių sudarymą ir klonavimą prieš sekos nustatymą, tuo tarpu klonuojant naudojant šautuvų seką sekos sudarymo metu praleidžiami nei chromosomų žemėlapiai, nei klonavimo etapai..

Klonas seka pagal klonus ir klonas naudojant šautuvus - tai du šiuolaikinio genomo sekos nustatymo metodai. Klonas klonavimo seka yra patikimesnis sekos sudarymo metodas. Tačiau klonavimo būdas, naudojant sekoskopą, yra greitesnis ir pigesnis. Straipsnyje pagrindinis dėmesys skiriamas subtiliajam skirtumui tarp klonų sekos klonavimo ir šautuvo sekos nustatymo.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra klonas, naudojant klonų seką 
3. Kas yra klonas naudojant šaudymo pistoleto seką
4. Klono sekos sekos ir šautuvo sekos panašumai
5. Lyginimas iš šono - klonas sekant klonais prieš šaudymo pistoletu seką lentelės forma
6. Santrauka

Kas yra „Clone by Clone Sequencing“?

Klonas klonavimo seka yra genomo sekos nustatymo metodas. Prieš padalijant DNR, reikia nubrėžti kiekvieną chromosomą. Atlikus kartografiją, DNR turėtų būti suskaidyta į 150 kilovatų ilgio fragmentus. Šie fragmentai yra paruošti sekai. Kitas žingsnis yra DNR fragmentų įdėjimas į bakterijų dirbtines chromosomas (BAC), o po to į bakterijų ląsteles. Kadangi fragmentai yra bakterijų ląstelių viduje, kiekvieną kartą, kai bakterijos dalijasi, įterpti DNR fragmentai taip pat dalijasi ir gamina daug identiškų kopijų. Tada atskiro bakterinio klono DNR suskaidoma į 500 bazių porų ilgio fragmentus. Jie yra mažesni ir persidengiantys fragmentai. Toliau seka vyksta įterpiant šiuos fragmentus į vektorių su žinoma DNR seka. Pradėjus nuo žinomos vektoriaus sekos, sekos tęsiamos iki nežinomos sekos.

Baigę seką, būtina nustatyti sutampančių sekų sritis. Po to fragmentai sujungiami, kad būtų suformuoti didesni fragmentai, iš pradžių pateikti BAC. Toliau didesnių fragmentų surinkimas į chromosomą vyksta pagal genomo žemėlapį.

01 paveikslas: Klonas klonavimo seka

Reikšmingas klono pranašumas atliekant klonų seką yra tai, kad iš anksto paruoštas genomo žemėlapis padeda patikimai surinkti didesnius fragmentus. Tačiau šio sekos nustatymo metodo trūkumas yra tas, kad genomo žemėlapių generavimas ir klonų darymas užima daug laiko. Tačiau šiam metodui buvo teikiama pirmenybė vykdant „Žmogaus genomo projektą“..

Kas yra klonas pagal šaudymo pistoleto seką?

Klonavimas šautuvu seka yra sekos sudarymo metodas, kuris atsitiktine tvarka suskaido DNR sekas į daugelį mažų fragmentų ir vėl surenka seką stebėdamas sutampančias sritis. Didesnius žinduolių genomus sunku klonuoti seka ir surinkti. Taip yra dėl jų struktūrinio sudėtingumo ir dydžio. Nors klonas sekos nustatymo metodu yra patikimas, sudėtingų organizmų genomų sekos nustatymas užtrunka ilgai. Todėl klonavimas naudojant šautuvų seką tapo patikimu pigesniu sekos nustatymo metodu, kurį galima atlikti greičiau. Taigi, šiuolaikiniai mokslininkai remiasi šiuo sekos sudarymo metodu, kad galėtų išspręsti sudėtingus genomus.

02 paveikslas: Klonas šaudymo pistoletu sekos

Atliekant klonavimą šautuvu sekvenavimo metodu, tradiciniai genomo kartografavimo ir klonavimo etapai neatliekami. Iš pradžių visas genomas yra suskaidomas į įvairaus dydžio - nuo 20 kilobazių iki 300 kilobazių. Kitas, sekos vyksta. Tada, naudojant sudėtingą kompiuterinę programinę įrangą, reikia surinkti fragmentus, žiūrint į sutampančius regionus.

Klonavimas šautuvu seka padeda pagerinti esamų genomo sekų tikslumą. Pagrindinis šio metodo pranašumas yra tas, kad jis yra daug greitesnis ir pigesnis už klonavimą sekos nustatymo metodu. Tačiau šis procesas nereikalauja genetinio žemėlapio naudojimo. Taigi labiau tikėtina, kad surinkimo metu bus padaryta klaidų. Taigi tai yra pagrindinis klonų, padarytų naudojant kulkosvaidžių sekos sudarymo metodą, trūkumas.

Kokie yra klonų sekos sekimo ir šautuvo sekos panašumai?

• Abu klonai sekoskopu ir šautuvu sekos yra du genomo sekos nustatymo metodai.
• Abiejų sekos sudarymo būdų metu suskaidytų fragmentų surinkimas atliekamas nustatant sutampančias sritis.
• Taip pat DNR suskaidymas į mažesnius fragmentus yra būtinas tiek klonui, tiek šautuvui sekuoti.

Kuo skiriasi klonas naudojant klonų seką ir karabinų seką?

Klonas klonavimo seka technika apima du pagrindinius etapus: chromosomų žemėlapių sudarymą ir klonavimą. Atvirkščiai, klonuojant šaudymo iš pistoleto eiga, šie du žingsniai neatliekami; jis atsitiktinai suskaido DNR sekas į daugelį mažų fragmentų ir vėl surenka seką stebėdamas sutampančias sritis. Taigi tai yra pagrindinis skirtumas tarp klono sekos nustatymo klonu ir šautuvo sekos nustatymo. Dėl šio veiksnio klonavimas pagal klonus yra brangus ir daug laiko užimantis procesas, o klonuoti naudojant pistoletą - greitesnis ir pigesnis.

Tačiau rečiau, kad montuojant padaryta klaida, klonas gali būti atliekamas sekos klonavimo metu. Taigi, jis yra labai patikimas. Vis dėlto klonas naudojant šautuvų seką yra palyginti mažiau patikimas metodas. Taigi, tai taip pat yra reikšmingas skirtumas tarp klono klonavimo ir pistoleto sekos nustatymo.

Žemiau esančioje informacinėje grafikoje pateikiama daugiau informacijos apie skirtumą tarp klonų sekos sekos ir šautuvo sekos.

Santrauka - klonas pagal klonų seką prieš šautuvo seką

Apibendrinant skirtumą tarp klono klonavimo ir pistoleto sekos nustatymo, klonas sekuojant klonu ir pistoleto sekvenavimas yra du genomo sekos nustatymo metodai. Tačiau klonavimas naudojant klono sekos nustatymo metodą apima ir genomo žemėlapių sudarymo, ir klonavimo procesus, tuo tarpu klonas naudojant šautuvu seką. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp klono klonavimo ir pistoleto sekos nustatymo. Kadangi genomo kartografavimas atliekamas klono metu pagal klonų seką, sekos surinkimo metu klaidos yra mažiau tikėtinos. Tačiau klonavimas šaudymo pistoletais seka yra daug greitesnis ir pigesnis procesas. Vis dėlto jis yra palyginti mažiau patikimas. „Žmogaus genomo projekto“ metu pirmenybinis sekos nustatymo būdas buvo klonas klonavimo būdu. Tačiau šiuolaikinis molekulinis biologas labiau remiasi klonu, atlikdamas šautuvo seką.

Nuoroda:

1. „Kas yra sekimas pagal klonus? Faktai, 2014 m. Lapkričio 17 d. „Wellcome Genome“ miestelio visuomenės dalyvavimo komanda, galima rasti čia.
2. „Kas yra šaudymo pistoleto sekvenavimas?“ Faktai, 2014 m. Lapkričio 17 d. „Wellcome Genome“ miestelio visuomenės dalyvavimo komanda, galima rasti čia.

Vaizdo mandagumas:

1. Alexpicardal97 „Molekulinio klonavimo žingsniai“ - Savas darbas, CC BY-SA 4.0) per „Commons Wikimedia“
2. Nacionalinio žmogaus genomo tyrimų instituto „Nacionaliniai sveikatos institutai“ šaudymo pistoleto sekos nustatymas lg “. Nacionalinis žmogaus genomo tyrimų institutas. „Kalbanti genetinių terminų žodynėlis“. Gauta 2016 m. Lapkričio 17 d. (Viešas domenas) per „Commons Wikimedia“