Skirtumas tarp egzomo ir stenogramos

Pagrindinis skirtumas - „Exome vs Transcriptome“
 

Genas turi koduojančius ir nekoduojančius regionus. Koduojančios sekos yra žinomos kaip egzonai, o nekoduojančios sekos yra žinomos kaip intronai. Geno egzonų nukleotidų seka parodo genetinį geno kodą, kad būtų galima sintetinti specifinį baltymą. Taigi egzonai lieka mRNR molekulėje. Bendras egzomo genomo regionas yra žinomas kaip egzomas, ir tai yra svarbi genomo dalis. Genų genetinis kodas paverčiamas mRNR molekulės genetiniu kodu, kuris reikalingas baltymui gaminti. Visos mRNR molekulės, perrašytos ląstelėje ar ląstelių populiacijoje, yra žinomos kaip transkriptas. Esminis skirtumas tarp egzomo ir nuorašo yra tas egzomas žymi genomo egzonų sričių sekas kol transkriptas parodo bendrą ląstelės ar audinio mRNR tam tikru metu.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra Exome
3. Kas yra transkriptas
4. Šalutinis palyginimas - Exome vs Transcriptome
5. Santrauka

Kas yra Exome?

Genai sudaryti iš egzonų, intronų ir reguliavimo sekų. Egzonai yra geno sritys, kurios transkripcijos metu yra transkribuotos į mRNR seką. Transkripcijos metu intronai ir kiti nekoduojantys regionai pašalinami. Egzonų nukleotidų seka nustato geno, kuris sintezuoja specifinį baltymą, kurį jis koduoja, genetinį kodą. Baltymo mRNR lieka tik egzonai. Egzonų kolekcija genome yra žinoma kaip organizmo egzome. Tai reiškia genomo dalį, kuri yra išreikšta genuose. Žmonėms egzome sudaro 1% genomo. Tai yra baltymą koduojanti žmogaus genomo dalis.

01 paveikslas: Exome

Kas yra transkriptas?

Transkriptas yra visų baltymus koduojančių ir nekoduojančių nuorašų (RNR) rinkimas tam tikrame audinyje. Transkriptas parodo visų mRNR molekulių, išreikštų genų ląstelėje ar audinyje, rinkinį. Ląstelės transkriptą galima keisti su kito tipo ląstelės transkriptu. Transkriptas taip pat yra dinamiškas - jis keičiasi laikui bėgant, reaguojant tiek į vidinius, tiek į išorinius dirgiklius. Net tame pačiame audinyje ar to paties tipo ląstelėse transkriptoma gali pasikeisti po kelių minučių.

Transkriptas skiriasi nuo organizmo egzomo. Transkriptas apima tik išreikštas egzomo sekas. Nors ląstelės egzome išlieka ta pati, transkriptas skirtingose ​​ląstelėse skiriasi, nes genų ekspresija nėra vienoda visoms ląstelėms ar audiniams. Tik esminiai genai yra ekspresuojami skirtingose ​​ląstelėse ir audiniuose. Genų ekspresija yra audinių ar ląstelių tipo specifinis procesas. Tai reguliuoja įvairūs veiksniai, įskaitant aplinkos veiksnius. Todėl transkripcija gali skirtis atsižvelgiant į išorės aplinkos sąlygas.

Transkriptas naudojamas kaip proteomikos tyrimų pirmtakas. Visi baltymai yra gaunami iš mRNR sekų. Dėl transliacinių modifikacijų gali pakisti baltymai. Tačiau transkriptas suteikia svarbią pagrindinę informaciją proteomikos tyrimams.

02 paveikslas: Embrioninių kamieninių ląstelių transkriptas

Kuo skiriasi „Exome“ ir „Transcriptome“?

„Exome vs Transcriptome“
Exome yra baltymus koduojančių genų srities rinkinys.	Transkriptas yra visų transkribuotų RNR, įskaitant mRNR, rinkinys.
Pavyzdys
Exome tiriamas naudojant DNR mėginį.	Transkriptas tiriamas naudojant RNR mėginį.
Studijų metodas
Egzamino sekos nustatymas yra egzomo tyrimo metodas.	RNR sekos nustatymas yra transkriptomo tyrimo metodas.

Santrauka - Exome vs Transcriptome

Egzonai yra koduojančios genų sekos ir nustatančios baltymų mRNR sekas. Šių koduojančių sekų (egzonų) kolekcija yra vadinama organizmo egzome. Genai perrašomi į mRNR molekules prieš gaminant baltymus. Bendros ląstelės ar audinio mRNR molekulės tam tikru metu yra žinomos kaip transkriptomos. Transkriptas parodo genus, kurie tam tikru metu yra aktyviai ekspresuojami į mRNR. Transkriptas yra specifiškas ląstelėms ir audiniams ir turi įtakos aplinkos sąlygoms. Tai yra skirtumas tarp egzomo ir nuorašo.

Nuorodos:
1.Sarah ir kt., „Dvylikos žmonių pajamų tikslinis gaudymas ir masyvi lygiagreti sekos“. Gamta. JAV nacionalinė medicinos biblioteka, 2009 m. Rugsėjo 10 d. Internetas. 2017 m. Balandžio 1 d
2.Mutzas ir kt. „Transkripto analizė naudojant naujos kartos seką.“ „Elsevier“: straipsnių ieškiklis. N.p., 2012 m. Rugsėjo mėn. Internetas. 2017 m. Balandžio 1 d

Vaizdo mandagumas:
1. „Grykovic, M. ir M. Ramalho-Santos, M.,„ Pluipotentinių ląstelių transkriptas “,„ Daugiašakis transkriptas (2008 m. Spalio 10 d.), StemBook, red. Kamieninių ląstelių tyrimų bendruomenė, „StemBook“, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] „DirectStemBook“ 2 pav. Pluripotentinių ląstelių transkriptas.Grskovic, M. ir Ramalho-Santos, M., Pluripotentinių transkriptų sąrašas (2008 m. Spalio 10 d.), „StemBook“, red. Kamieninių ląstelių tyrimų bendruomenė, „StemBook“, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, (CC BY 3.0) per „Commons Wikimedia“