Skirtumas tarp horizontalios ir vertikalios gelio elektroforezės

Pagrindinis skirtumas - horizontalios ir vertikalios gelio elektroforezė
 

Gelio elektroforezė yra laboratorijoje naudojama genetikos technika, skirta atskirti mišinius, kuriuose yra DNR, RNR ir kitų baltymų, atsižvelgiant į jų atitinkamą krūvį ir molekulinį dydį. DNR, RNR arba baltymai, kuriuos reikia atskirti taikant šį metodą, yra valomi per gelį, kuriame yra mažos poros. Molekulės varomos per gelį elektriniu lauku. Molekulės praeina pro gelio poras, o judėjimo greitis yra atvirkščiai proporcingas jų atitinkamam ilgiui. Todėl mažesnio molekulinio dydžio molekulės judės greičiau nei didesnės molekulinės masės molekulės. Elektrinį lauką sukuria krūvio skirtumas dviejuose gelio galuose. Viename gale yra teigiamas krūvis, o kitame gale yra neigiamas krūvis. Kadangi DNR ir RNR molekulės yra neigiamai įkrautos, jos bus traukiamos link teigiamo krūvio gelio galo. Gelio elektroforezė gali būti dviejų skirtingų metodų: horizontalios gelio elektroforezės ir vertikalios gelio elektroforezės.. Atliekant horizontalią gelio elektroforezę, gelis yra horizontalioje padėtyje ir yra panardinamas į nepertraukiamą veikimo buferį, esantį pačios gelio dėžutės viduje. Atliekant vertikalią gelinę elektroforezę, buferinė sistema yra nukreipta vertikaliai ir yra nedaloma su dviem kameromis, esančiomis viršuje ir apačioje, atitinkamai su katodu ir anodu.. Tai yra pagrindinis skirtumas tarp horizontalios ir vertikalios gelinės elektroforezės.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra horizontalaus gelio elektroforezė
3. Kas yra vertikalaus gelio elektroforezė
4. Horizontalios ir vertikalios gelio elektroforezės panašumai
5. Lyginimas šalia - horizontalios ir vertikalios gelio elektroforezė lentelės pavidalu
6. Santrauka

Kas yra horizontalaus gelio elektroforezė?

Horizontalioje gelio elektroforezėje naudojama pagrindinė DNR, RNR arba baltymų molekulių atskyrimo pagal jų atitinkamą molekulinį dydį ir krūvį teorija. Taikant šį metodą, gelis yra horizontalioje padėtyje ir yra panardinamas į nepertraukiamą buferį. Agarozės gelis naudojamas gelio dėžutei atskirti į du skyrius. Viename gelio dėžutės gale yra anodas, o kitame katodas. Kai taikoma srovė, šioje technikoje naudojamas buferis leidžia sukurti įkrovos gradientą. Pritaikius įkrovą, gelis linkęs įkaisti. Buferis taip pat veikia kaip aušinimo skystis, palaikantis optimalią temperatūrą. Bėgimo buferio recirkuliacija neleidžia susidaryti pH gradientui. Netolygaus buferio sistemos negalima naudoti atliekant horizontalią gelio elektroforezę, nes du gelio sistemos skyriai yra sujungti su tekančiu buferiu. Akriamidas naudojamas gelinės elektroforezės metu baltymų mišiniams atskirti.

01 paveikslas: Horizontalioji gelio elektroforezė

Horizontalioje gelio elektroforezėje akrilamidas negali būti naudojamas, nes gelio dėžutė yra veikiama deguonies. Dėl deguonies yra slopinama akrilamido polimerizacija, ir tai trukdo susidaryti geliui. Horizontalioji gelinė elektroforezė yra nesudėtingas metodas, naudojamas atskyrus DNR ir RNR.

Kas yra vertikali gelio elektroforezė?

Vertikalios gelinės elektroforezės technika veikia pagal pirminę gelio elektroforezės teoriją, tačiau ji laikoma sudėtingesne nei horizontaliojo gelio elektroforezės metodas. Ši technika naudoja nepertraukiamą buferį. Katodas yra viršutinėje kameroje, o anodas - apatinėje kameroje. Kiekviename skyriuje esantys elektrodai sukuria reikiamą elektrinį lauką. Tarp dviejų pritvirtintų stiklo plokščių pilamas plonas gelio sluoksnis. Todėl viršutinė gelio dalis yra panardinama į viršutinę kamerą, o apatinė gelio dalis yra panardinama į kamerą apačioje. Įjungus srovę, nedidelė buferio dalis iš viršutinės kameros per gelį pereina į apatinę kamerą. Šioje technikoje naudojama minutė yra vienetai.

02 pav.: Vertikali gelio elektroforezė

Atliekant vertikalią gelio elektroforezę, buferis teka tik per gelį. Tai leidžia tiksliai valdyti įtampos gradientą atskyrimo metu. Galima naudoti akrilamido gelį, nes skyriai nėra veikiami atmosferos deguonies. Dėl mažesnio akrilamido gelio porų dydžio, tikslesnį atskyrimą galima pasiekti didesne skiriamąja geba.

Kokie yra horizontalaus ir vertikalaus gelio elektroforezės panašumai?

• Abi sistemos veikia pagal pagrindinę gelio elektroforezės teoriją.
• Anodas ir katodas naudojami norint suteikti reikiamą elektrinį lauką abiejose sistemose.

Kuo skiriasi horizontalaus ir vertikalaus gelio elektroforezė?

Horizontali ir vertikali gelio elektroforezė
Horizontalioji gelio elektroforezė yra gelio elektroforezės technika, kurios metu gelis yra horizontalioje padėtyje..	Vertikalaus gelio elektroforezė yra gelio elektroforezės technika, kurios metu gelis orientuojamas vertikaliai.
Buferis
Horizontalią gelio elektroforezę sudaro ištisinis buferis.	Veikiantis buferis vertikalios gelinės elektroforezės metu yra pertraukiamas.
Akrilamido naudojimas
Akrilamido negalima naudoti atliekant horizontalią gelio elektroforezę, nes gelio dėžutė yra veikiama atmosferos deguonies.	Kadangi gelis nėra veikiamas atmosferos deguonies dėl dviejų atskirų kamerų, vertikalios gelinės elektroforezės tikslais galėtų būti naudojamas akrilamidas..
Funkcija
Horizontalioji gelinė elektroforezė dažniau naudojama atskirti DNR ir RNR mišinius, bet ne baltymus.	Baltymų mišiniams atskirti naudojama vertikali gelinė elektroforezė.

Santrauka - horizontalios ir vertikalios gelio elektroforezė

Gelio elektroforezė yra laboratorinė technika, plačiai naudojama atskiriant mišinius, kuriuose yra DNR, RNR ir baltymų molekulių. Yra du gelio elektroforezės metodai: horizontalioji ir vertikalioji gelinė elektroforezė. Horizontalioje gelinėje elektroforezėje bėgimo buferis yra nepertraukiamas, o vertikalioje gelinėje elektroforezėje - nenutrūkstamas. Tai yra skirtumas tarp horizontalios ir vertikalios gelinės elektroforezės. Abi sistemos veikia pagal bendrą gelinės elektroforezės principą.

Atsisiųsti horizontalios ir vertikalios gelio elektroforezės PDF versiją

Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatos pastaboje. Atsisiųskite PDF versiją čia. Horizontaliojo ir vertikalaus gelio elektroforezės skirtumas.

Nuorodos:

1.Warrenas, Chadas M. ir kt. „Vertikali agarozės gelio elektroforezė ir didelio molekulinio svorio baltymų elektrobliftavimas“. Elektroforezė, vol. 24, Nr. 2003, 11, p. 1695–1702., Doi: 10.1002 / elps.200305392.
2. „Horizontalios ir vertikalios gelio sistemos - horizontalios gelio sistemos“. Nacionalinė diagnostika, prieinama čia. Prisijungta 2017 m. Rugpjūčio 28 d.

Vaizdo mandagumas:

1. „Gelio elektroforezės aparatas“, autorius Jeffrey M. Vinocur - Savas darbas (CC BY 2.5) per „Commons Wikimedia“
2. „Poliakrilamido gelio baltymų elektroforezė“, pateikė Jean-Etienne Minh-Duy Poirrier iš Bruxelles, Belgija. Baltymai 1D gelio elektroforezėje (CC BY-SA 2.0) per „Commons Wikimedia“.