Skirtumas tarp maksimalios parsimonijos ir didžiausios tikimybės

pagrindinis skirtumas tarp maksimalios paraimonijos ir didžiausios tikimybės priklauso nuo metodo, naudojamo kuriant filogenetinį medį. Maksimalus parodijavimas yra nukreiptas į visų simbolių būsenų minimizavimą filogenetinio medžio konstravimo metu, tuo tarpu didžiausia tikimybė yra statistinis metodas piešiant filogenetinį medį, atsižvelgiant į genetinių duomenų tikimybę..

Filogenija yra naujas požiūris į organizmų klasifikavimą ir nomenklatūrą. Filogenija remiasi genetiniais duomenimis ir evoliucijos ryšiais. Genetiniai duomenys yra DNR sekos rezultatas. Filogenezėje organizmai klasifikuojami remiantis bendru protėviu. Maksimalus filogenetinio ryšio įrodymas ir tikimybė padidina filogenetinio medžio tikslumą ir patikimumą.

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kokia yra maksimali pareiga 
3. Kokia yra didžiausia tikimybė
4. Panašumai tarp maksimalios parodijos ir didžiausios tikimybės
5. Lyginimas iš šono - didžiausia parodymai ir maksimali lentelės formos tikimybė
6. Santrauka

Kas yra maksimalus Parsimony?

Maksimalios paraimonijos technikoje filogenetinės analizės metu minimizuojami visi charakterio būklės pokyčiai. Filogenetika yra biologijos šaka, nagrinėjanti evoliucijos ryšius. Filogenetinis medis yra medis, kuris parodo evoliucijos ryšius, pagrįstus bendru protėviu. Taigi, piešiant filogenetinį medį, naudojant maksimalios parsimonijos sąvoką, lygiagrečios evoliucijos suma yra sumažinta iki minimumo. Todėl maksimalus parėmimas medį sugeneruos daug greičiau nei kiti metodai. Taip yra todėl, kad maksimaliai parimant atsižvelgiama tik į pagrindines skiriamąsias savybes.

01 paveikslas: Maksimali pareiga

Piešdamas maksimalų parodomąjį medį, jis visada yra trumpiausias įmanomas medis su minimaliu taksonų skaičiumi. Tačiau maksimaliai apgaulingo medžio patikimumas yra labai didelis. Statistinis filogenetinio ryšio nuoseklumas ir tikslumas, remiantis maksimalia paraimonyne, skirsis. Be to, yra sudėtingų algoritmų, analizuojančių maksimalią filogenetinio santykio mintį.

Kokia yra didžiausia tikimybė?

Maksimali tikimybė yra vienas iš labiausiai naudojamų statistinių metodų, analizuojančių filogenetinius ryšius. Metodas analizuos filogeniją remiantis tikimybės modeliu. Be to, šis metodas atsižvelgia ir į vidurkį, ir į dispersiją. Taigi filogenezėje gaunama didžiausia tikimybė, atsižvelgiant į duotus konkretaus organizmo genetinius duomenis.

02 paveikslas: Didžiausia tikimybė

Didžiausio tikimybės statistinio metodo naudojimas turi ir privalumų, ir trūkumų. Šis metodas yra labai tinkamas analizuojant paprastą duomenų rinkinį, kuriame yra genetinė informacija. Kai genetinių duomenų dispersijos laipsnis yra mažesnis, maksimalios tikimybės balai yra patikimi. Rezultatai, gauti naudojant maksimalią tikimybę, dar labiau patvirtina maksimalų tam tikro filogenetinio ryšio parodymų balus. Todėl maksimalios tikimybės analizė yra patvirtinantis testas.

Palyginus su aukščiau paminėtais pranašumais, šis metodas yra lėtas ir intensyvus procesas. Be to, nesant vieno duomenų rinkinio, klaidų išvestis yra didelė. Taigi, įvertinus maksimalią tikimybę, tai taip pat apsunkina rezultatų atkuriamumą.

Kokie yra maksimalios parodijos ir didžiausios tikimybės panašumai?

• Maksimali pareiga ir maksimali tikimybė yra du požiūriai, vaidinantys svarbų vaidmenį filogenezijoje.
• Remiantis turimais genetiniais duomenimis, abu būdai parodo organizmo santykį su jo protėviu.
• Filogenetiniai medžiai gali būti aiškinami naudojant tiek maksimalų parsimony, tiek didžiausią tikimybę.
• Abiejuose metoduose genetiniai duomenys priklauso nuo DNR arba RNR sekos.
• Abu metodai yra svarbūs generuojant filogenetinius medžius.

Kuo skiriasi maksimali parodija ir maksimali tikimybė?

Tiek maksimali pareimija, tiek didžiausia tikimybė yra du skirtingi filogenetinio medžio aiškinimo metodai. Maksimalus bandymas tiki išanalizuoti keletą savybių ir kiek įmanoma sumažinti charakterio pokyčius kiekviename organizme. Atvirkščiai, maksimalios tikimybės metodas atsižvelgia ir į vidurkį, ir į dispersiją, taip gaunant maksimalią tikimybę pagal tam tikrus organizmo genetinius duomenis. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp maksimalios parodijos ir didžiausios tikimybės.

Be to, vien tik maksimalios parodymų patikimumas nėra pakankamas išvadai padaryti. Tačiau maksimalios tikimybės metodas veikia kaip patvirtinantis maksimalios parsimonijos rezultatų patikrinimas. Taigi išvados turėtų būti daromos naudojant tiek maksimalų parodymą, tiek maksimalią tikimybę.

Žemiau pateiktoje infografijoje apibendrinamas skirtumas tarp maksimalaus parsimonio ir didžiausios tikimybės.

Santrauka - maksimali parsimonija vs maksimali tikimybė

Filogenija vaidina svarbų vaidmenį kuriant evoliucijos ryšius konstruodama filogenetinius medžius. Maksimali paraimonystė yra medžio konstravimo technika su minimaliu simbolių būklės pakeitimo būdu. Priešingai, didžiausia filogenetinio medžio tikimybė priklauso nuo maksimalaus genetinių duomenų panašumo. Abiejų analizių duomenys gaunami iš DNR arba RNR sekų duomenų. Patikimumas ir tikslumas yra didelis, kai medžio statyba vykdoma naudojant abu būdus. Taigi, tai apibendrina skirtumą tarp maksimalios parodijos ir didžiausios tikimybės.

Nuoroda:

1. Elliotas. „Konkursas tarp Parsimony ir Tikimybės“. OUP Akademinė, „Oxford University Press“, 2004 m. Rugpjūčio 1 d., Galima rasti čia.

Vaizdo mandagumas:

1. „Maksimalus B2b haplogrupės parsimonijos medis“, autoriai Taboada-Echalar P, Álvarez-Iglesias V, Heinz T, Vidal-Bralo L, Gómez-Carballa A, Catelli L ir kt. (2013) Prekolonijinio laikotarpio genetinis palikimas šiuolaikiniuose Bolivijoje. „PLOS ONE 8“ (3): e58980. doi: 10.1371 / journal.pone.0058980 (CC BY 2.5) per „Commons Wikimedia“
2. „Maksimalus„ Lactarius blennius “ir„ relativs “medis. Naudotojas: Thkgk - Nuosavas darbas (CC0) per„ Commons Wikimedia “