Skirtumas tarp zondo ir grunto

Pagrindinis skirtumas - zondas vs gruntas
 

Molekulinis zondas yra mažas DNR arba RNR fragmentas, atpažįstantis DNR arba RNR komplementarines sekas ir leidžiantis identifikuoti tikslinę seką. Pradmuo yra nedidelis DNR arba RNR ruožas, kuris yra pradinis taškas DNR sintezei. Pradmenys ir zondai hibridizuojasi su šabloninės DNR arba tikslinės DNR komplementariais nukleotidais. Tačiau pagrindinis skirtumas tarp zondo ir grunto yra tas pradmenys yra būtini DNR replikacijai, o zondai yra reikalingi specifinėms sekoms nustatyti DNR mėginyje.

TURINYS
1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra zondas
3. Kas yra gruntas
4. Šalutinis palyginimas - zondas vs gruntas
5. Santrauka

Kas yra zondas?

Zondas yra nedidelis DNR ar RNR fragmentas, naudojamas tiriamai DNR ar RNR mėginyje aptikti molekulinės hibridizacijos būdu. Jie taip pat žinomi kaip molekuliniai žymekliai. Zondo ilgis gali skirtis (nuo 100 iki 1000 bazių), o zondo nukleotidai papildo taikinio sekos dalį. Kad būtų lengviau aptikti, zondai yra paženklinti radioaktyviaisiais izotopais arba fluorescenciniais dažais ar antikūnais. Zondai jungiasi su papildomomis taikinio sekos bazėmis ir atskleidžia tikslinės DNR arba RNR buvimą mėginyje. Yra du pagrindiniai zondo ženklinimo būdai: pabaigos žymėjimas ir slapyvardžio vertimas. Zondai yra suskirstyti į įvairius tipus, įskaitant DNR, RNR, cDNa ir sintetinių oligonukleotidų zondus. Jie yra paruošti naudojant skirtingus metodus..

Zondai yra svarbūs įrankiai daugelyje mikrobinių ir molekulinių sričių, tokių kaip virusologija, teismo medicinos patologija, tėvystės tyrimai, DNR pirštų atspaudai, genetinių ligų nustatymas, RFLP, molekulinė citogenetika., savo vietoje hibridizavimas ir kt.

01 paveikslas: Fluorescenciškai pažymėtas zondas, naudojamas FISH patogeno nustatymui

Kas yra gruntas?

Pradmuo yra trumpas DNR arba RNR fragmentas, kuris yra DNR sintezės iniciatorius. DNR polimerazės fermentas prideda nukleotidus prie 3 'OH grupės pradmenų sekos ir sintezuoja naują grandinę, papildančią šabloninę DNR. Pradmenys yra labai trumpi fragmentai, kurių ilgis yra nuo 18 iki 20 nukleotidų. Jie chemiškai sintezuojami laboratorijoje in vitro DNR amplifikacija (PGR). Pradmenys gali turėti bet kokią nukleotidų seką, nes juos suprojektavo vartotojas. Jie sintetinami taip, kad atitiktų šablono DNR papildomas bazes. Todėl ji gali turėti bet kokią nukleotidų seką. Pradmenys yra nepaprastai svarbūs DNR replikacijai, nes DNR polimerazė negali sintetinti naujos DNR be jau esančio DNR gabalo. Projektuojant pradmenis PGR, reikia atsižvelgti į šiuos dalykus:

• Pradmenis turėtų sudaryti papildomi nukleotidai, esantys prie DNR, norinčio amplifikuoti, šono.
• Gruntų lydymosi temperatūra turėtų būti nuo 55 iki 65 ⁰C
• G ir C kiekis turėtų būti nuo 50 iki 60%.

Du pradmenys naudojami PGR kaip pirmyn ir atgal, kad būtų galima pakartoti abi mėginio DNR grandines. Pradmenys dažniausiai naudojami atliekant PGR ir DNR seką.

02 pav.: Grunto atkaitinimas PGR

Kuo skiriasi zondas nuo „Primer“?

Zondas prieš gruntą
Zondas yra nedidelis DNR / RNR fragmentas, naudojamas aptikti tikslinės sekos buvimą mėginyje molekulinės hibridizacijos būdu..	Pradmuo yra nedidelis DNR arba RNR ruožas, kuris yra pradinis taškas DNR replikacijai.
Funkcija
Tai nustato specifinės sekos buvimą DNR arba RNR mėginyje.	Tai veikia kaip atskaitos taškas DNR sintezei.
Ilgis
Ilgis gali būti nuo 100 iki 1000 bazių	Paprastai ilgis yra apie 18 - 20 bazių
Įrišimas papildoma seka
Zondas hibridizuojasi su papildomomis tikslinės sekos bazėmis	Grunto atkaitinimas su DNR grandinių papildomomis bazėmis.
Ženklinimas
Zondai yra paženklinti, kad būtų lengviau juos aptikti	Gruntai paprastai nėra paženklinti
Naudojimas atliekant PGR
Zondai PGR nenaudojami	Pradmenys naudojami PGR

Santrauka - zondas vs gruntas

Zondas yra nedidelis DNR arba RNR sekos fragmentas, kurį galima hibridizuoti su komplementariais nukleotidais, kad pavyzdyje būtų aptikta tikslinė seka. Zondai žymimi radioaktyviai, imunologiškai arba fluorescuojančiai, kad būtų galima pamatyti tikslinę seką. Pradmuo yra labai mažas DNR arba RNR fragmentas, kuris veikia kaip atskaitos taškas in vitro DNR amplifikacija. DNR polimerazė identifikuoja 3 'OH grupės pradmenis ir inicijuoja naujos, šabloną papildančios grandinės, kūrimą. Zondai ir pradmenys veikia panašiai, hibridizuodamiesi su papildomais nukleotidais. Taigi pagrindinis zondo ir pradmens skirtumas yra jų pagrindinė funkcija.

Nuoroda:
1. „Pradmuo (molekulinė biologija).“ Vikipedija. „Wikimedia Foundation“, 2017 m. Vasario 2 d. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 1 d.
2. „Hibridizacijos zondas“. Vikipedija. „Wikimedia Foundation“, 2016 m. Gruodžio 30 d. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 1 d
3. „Pradmuo (molekulinė biologija).“ Gruntas (molekulinė biologija) - „ScienceDirect“ temos. N.p., n.d. Žiniatinklis. 2017 m. Kovo 1 d

Vaizdo mandagumas:
1. „ŽUVIS bakterinių patogenų identifikavimui“, autorius Pepetpsas Togopicas Ivanas Akira Magnusas ManskeTimothy W. Ford - (CC BY-SA 3.0) per „Wikimedia“
2. Richardas Wheeleris („Zephyris“) „Primers RevComp Melted2“ - Nuosavas darbas (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“