Skirtumas tarp proteomikos ir metabolizmo

pagrindinis skirtumas tarp proteomikos ir metabolomikos yra tai proteomika yra visų organizmo baltymų tyrimas, o metabolomika - visų organizmo metabolitų tyrimas.

Genomika yra genetinio organizmo sudėties tyrimas. Proteomika ir metabolomika yra du su genomika susiję omikos mokslai. Proteomas nurodo visus ląstelės ar organizmo baltymus. Kita vertus, metabolizmas reiškia visus organizmo metabolitus. Taigi, proteomos tyrimas yra proteomika, o metabolomo - metabolomika. Tiek proteomika, tiek metabolomika yra svarbios diagnozuojant ligą ir apibūdinant bei tiriant organizmus. Be to, abu yra susiję daugeliu ląstelių biologijos aspektų, ypač ląstelių signalizacijos, baltymų skaidymo ir generavimo bei posttransliacinio modifikavimo srityse..

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra proteomika
3. Kas yra metabolizmas
4. Proteomikos ir metabolizmo panašumai
5. Šalutinis palyginimas - lentelės formos proteomika ir metabolizmas
6. Santrauka

Kas yra proteomika?

Proteomas yra visas baltymo komplementas ląstelėje, audinyje ar organizme. Todėl proteomika yra organizmo proteomos tyrimas. Proteomikoje analizuojamos skirtingos baltymų savybės. Todėl proteomika daugiausia dėmesio skiria baltymų struktūrai, orientacijai, funkcijoms, baltymų sąveikai, modifikacijoms, pritaikymui ir baltymų svarbai. Būtent todėl šiuo metu vykdoma daugybė mokslinių tyrimų projektų proteomikos srityje.

Pirmieji proteominiai tyrimai buvo atlikti siekiant nustatyti baltymų kiekį Escherichia coli. Bendro baltymų kiekio žemėlapiai buvo atlikti naudojant dviejų matmenų (2D) gelius. Po šio projekto sėkmės mokslininkai pradėjo apibūdinti bendrą baltymų kiekį gyvūnuose, tokiuose kaip jūrų kiaulytės ir pelės. Šiuo metu žmogaus baltymų kartografavimas atliekamas naudojant 2D gelio elektroforezę.

Yra daug proteomikos studijų pranašumų, nes baltymai yra katalizuojančiosios savybės, dėl kurių baltymai yra didžiausio aktyvumo molekulės. Taigi sveikų baltymų tyrimas gali suteikti informacijos apie organizmo sveikatos būklę. Be to, proteomika gali būti naudojama daug kuriant genomo anotacijas, identifikuojant ligas ir diagnozuojant, atliekant baltymų ekspresijos tyrimus eksperimentų metu ir baltymų modifikavimo bei sąveikos tyrimus ir kt..

01 paveikslas: Proteomika

Proteomikoje yra įvairių metodų, įskaitant bendro baltymo ekstrahavimą, jų atskyrimą, naudojant 2D gelio elektroforezę, ekstrahuotų baltymų seką, naudojant tokius metodus kaip Edmundo sekos nustatymo metodas arba masės spektrometrija, ir baltymo struktūrinių bei funkcinių savybių analizę naudojant kompiuterinė programinė įranga ir bioinformatikos priemonės.

Kas yra metabolizmas?

Metabolomika yra visų metabolitų ląstelėje, audinyje ar organizme tyrimas. Tai apima ląstelių metabolitų identifikavimą ir kiekybinį nustatymą naudojant skirtingas pažangias analitines ir statistines priemones. Metabolomika yra svarbus tyrimas, nes atskleidžia informaciją apie organizmo metabolizmą.

02 paveikslas: Metabolomika

Metabolikai, norėdami ištirti metabolinių reakcijų substratus ir produktus, naudoja masės spektrometriją kaip analizės platformą. Masės spektrometrija lemia metabolitus ir jų koncentracijas, atspindinčius tikrąją ląstelių ar audinių biocheminę būklę. Taigi metabolomiką galima laikyti geriausiu organizmo molekulinio fenotipo vaizdavimu. Be to, metabolomika gali būti laikoma proteomikos pratęsimu, nes dauguma metabolitų susidaro dėl fermentų, kurie yra baltymai, aktyvumo..

Kokie yra proteomikos ir metabolizmo panašumai?

• Proteomika ir metabolomika yra du su genomika susiję omikos mokslai.
• Metabolomika gali būti laikoma proteomikos pratęsimu.
• Su daugeliu tyrimų baltymai ir metabolomai yra glaudžiai susiję.

Kuo skiriasi proteomika ir metabolizmas??

Proteomika yra didelio masto baltymų tyrimas, apimantis jų struktūrą ir funkcijas ląstelėje ar organizme. Tuo tarpu metabolomika yra metabolitų profilių tyrimas ląstelėje, audinyje ar organizme tam tikromis sąlygomis. Taigi, tai yra pagrindinis skirtumas tarp proteomikos ir metabolomikos. Be to, proteomika daugiausia susijusi su visu baltymų rinkiniu, tuo tarpu metabolomika daugiausia susijusi su visu metabolitų rinkiniu, įskaitant įvairų mažų molekulių, tokių kaip peptidai, angliavandeniai, lipidai, nukleozidai, ir išorinių junginių kataboliniai produktai, ir tt Todėl. dar vienas skirtumas tarp proteomikos ir metabolomikos.

Žemiau pateiktoje infografikoje apibendrinamas skirtumas tarp proteomikos ir metabolomikos.

Santrauka - Proteomika ir metabolizmas

Gyvus organizmus galima ištirti naudojant jų genomą, baltymus ir metabolitus. Genomika, proteomika ir metabolomika yra trys sritys, tiriančios atitinkamai ląstelės ar organizmo genetinį pagrindą, baltymus ir metabolitus. Proteomika yra svarbi, nes tai yra dinamiškas abiejų genų ir aplinkos atspindys. Metabolomika yra labai svarbi, nes ji tiesiogiai atspindi dabartinę ląstelių biocheminės reakcijos arba organizmo metabolinės būklės būklę. Taigi, tai apibendrina skirtumą tarp proteomikos ir metabolomikos.

Nuoroda:

1. P, Suratas. „Kaip metabolizmas ir baltymai yra susiję?“ Naujienos, 2019 m. Vasario 26 d., Galima rasti čia.
2. Horganas, Richardas P ir Louise C Kenny. „SAC apžvelgia„ Omic “technologijas: genomiką, transkriptiką, proteomiką ir metabolizmą“. Akušerija ir ginekologija, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 2011 m. Liepos 18 d., Galima rasti čia.

Vaizdo mandagumas:

1. „Proteomics“, sukurtas Xxl7441 anglų kalba, „Wikibooks“ - perkelta iš en.wikibooks į „Commons“. („Public Domain“) per „Commons Wikimedia“
2. „Metabolomikos schema“, pateikė Lmaps (aptarimas) - Aš pats sukūriau šį kūrinį (CC BY-SA 3.0) per „Commons Wikimedia“.