Skirtumas tarp proteomikos ir transkriptikos

Pagrindinis skirtumas - proteomika palyginti su transkriptika
 

Akių technologijos yra dabartinė tendencija, kai skirtingos organizmo biomolekulės yra vertinamos kaip visa kolekcija, atsižvelgiant į jo savybes ir funkcijas. „Omic“ technologija turi platų pritaikymą. Skirtingi biologinio mėginio omikai priklauso genomika, proteomika, transkriptika ir metabolomika. Proteomika apima išsamų visų gyvo organizmo baltymų tyrimą. Tai apibrėžiamas kaip visų organizme ekspresuotų baltymų rinkinys, jo struktūrinės ir funkcinės savybės. Taigi visas baltymų rinkinys sudaro baltymą. Transkriptika yra išsamus visų Messenger RNR (mRNR) molekulių, esančių gyvame organizme, tyrimas. Taigi, transkriptika susijusi su genais, kurie yra aktyviai ekspresuojami gyvame organizme. Visas gyvo organizmo mRNR rinkinys yra vadinamas transkriptu. pagrindinis skirtumas tarp proteomikos ir transkriptikos yra pagrįstas biomolekulės tipu. Proteomikoje tiriamas bendras ekspresuotų baltymų rinkinys gyvame organizme, tuo tarpu transkriptikoje - bendra gyvo organizmo mRNR..

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra proteomika
3. Kas yra transkriptika
4. Proteomikos ir transkriptikos panašumai
5. Lyginimas iš šono - lentelės formos proteomika ir transkriptika
6. Santrauka

Kas yra proteomika?

Terminas „proteomika“ buvo sugalvotas 1995 m. Ir iš pradžių buvo apibrėžtas kaip bendras baltymo papildas ląstelėje, audinyje ar organizme. Tobulėjant proteomikos tyrimams, jis vėliau buvo pakeistas, kad būtų laikomas skėtiniu terminu, į kurį buvo įtraukta daug studijų sričių. Šiuo metu proteomikos tema nagrinėjama baltymų struktūra, orientacija, funkcijos, sąveika, modifikacijos, pritaikymas ir baltymų svarba. Todėl šiuo metu proteomikos srityje atliekama daug tyrimų.

Pirmieji proteominiai tyrimai buvo atlikti siekiant nustatyti baltymų kiekį Escherichia coli. Bendro baltymų kiekio žemėlapiai buvo atlikti naudojant dviejų matmenų (2D) gelius. Kai tai pavyko, mokslininkai pradėjo apibūdinti bendrą baltymų kiekį gyvūnuose, tokiuose kaip jūrų kiaulytės ir pelės. Šiuo metu žmogaus baltymų kartografavimas atliekamas naudojant 2D gelio elektroforezę.

Proteomikos pritaikymas

Yra daug proteomikos tyrimų pranašumų, nes baltymai yra katalizuojančiosios savybės, dėl kurių baltymai yra pagrindinės veiklos molekulės. Taigi sveikų baltymų tyrimas gali suteikti informacijos apie organizmo sveikatos būklę. Kai kurios programos yra;

1. Genomo anotacija: Ištyrus baltymų kiekį organizme, galima nustatyti tikslius genomus, atsakingus už aktyvų baltymų junginį. Šiame scenarijuje svarbūs visos genomikos, transkriptikos ir proteomikos rezultatai.
2. Ligos nustatymas / diagnostika: Proteomika naudojama nustatant ligos būklę, lyginant sveikus ir sergančius
3. Įvykdyti baltymų ekspresija mokėsi eksperimento metu.
4. Baltymų modifikacijos ir sąveikos tyrimai: Tam, kad baltymai būtų naudojami in vitro sąlygos arba ir in vivo sąlygos, nuspręsti šių ekstrahuotų baltymų laikymo sąlygas ir ištirti baltymų elgseną in vitro, in vivo ir in - silico metodai.

01 paveikslas: Proteomika

Yra skirtingi proteomikos metodai

1. Bendro baltymo ekstrahavimas ir baltymų atskyrimas naudojant 2D gelio elektroforezę. Baltymus taip pat galima atskirti naudojant didelio efektyvumo skysčių chromatografiją (HPLC)..
2. Ekstrahuotų baltymų sekos nustatymas tokiais metodais kaip Edmundo sekos nustatymo metodas arba masių spektrometrija.
3. Nustačius sekas, baltymų turinio struktūrinės ir funkcinės savybės analizuojamos naudojant kompiuterinę programinę įrangą ir bioinformatikos priemones..

Kas yra transkriptika?

Transkripto terminas yra sugalvotas neseniai. Transkriptika yra viso organizmo mRNR kiekio tyrimas. Bendra mRNR yra ekspresuota DNR gyvame organizme arba ląstelėje. Visas mRNR rinkinys yra vadinamas transkriptu.

Transkripto analizės žingsniai apima:,

1. RNR ekstrahavimas, mRNR atskyrimas naudojant kolonėlės gelio chromatografiją su poli DT granulėmis.
2. Atlikta mRNR seka.

Mikro matricų technologija yra vienas įprastų būdų identifikuoti organizmo transkriptą. Mikro matricos technika apima zondo plokštelę su papildomomis transkripto gijomis. Hibridizacijos metu galima apibūdinti organizme arba ląstelėse esančią mRNR.

02 paveikslas: Transkriptikos metodai

Transkriptika dabar plačiai naudojama medicinos srityje. Ligos diagnostika ir profiliavimas yra pagrindinės sritys, kuriose naudojama transkriptika. Išanalizavus organizmo transkriptą, galima nustatyti svetimą mRNR, o jei yra kokių infekcijų, ją galima nustatyti. Nekoduojamą RNR galima atskirti naudojant transkriptomines technologijas. Taip pat galima stebėti genų raišką esant skirtingiems aplinkos stresams.

 Kokie yra proteomikos ir transkriptikos panašumai?

• Jie abu yra „omic“ technologijos sąvokos dalis.
• Abu jie naudojami diagnozuojant ligas ir apibūdinant organizmo ligas.
• Abi tyrimo sritys apėmė biomolekulės išgavimą, biomolekulės atskyrimą ir sekos sudarymo veiksmus.

Kuo skiriasi proteomika ir transkriptika?

Protemika vs transkriptika
Proteomika apima išsamų visų gyvo organizmo baltymų tyrimą.	Transkriptika yra išsamus visų Messenger RNR (mRNR) molekulių, esančių gyvame organizme, tyrimas.
Studijuojamas biomolekulės tipas
Baltymai tiriami proteomikoje.	mRNR tiriama transkriptikoje.
Ištirti veiksniai
Proteomikoje tiriama baltymų struktūra, funkcijos, sąveika, modifikacijos ir pritaikymas.	Transkriptomikoje tiriama sekos struktūra, sąveika su aplinka ir mRNR pritaikymas.

Santrauka - Proteomika palyginti su transkriptika 

Omika vaidina svarbų vaidmenį gyvybės mokslų srityje. Proteomika - tai proteomos, sudarančios visas baltymų kolekcijas ląstelėje ar organizme, tyrimas. Transkriptika reiškia transkripto, kuris yra visas išreikštos DNR, kuris yra mRNR, rinkinį. Dvi tyrimų sritys - proteomika ir transkriptika - buvo išvestos po genomikos įvedimo ir šiuo metu plačiai naudojamos medicininėje diagnostikoje bei apibūdinant ir tiriant organizmus. Tai yra skirtumas tarp proteomikos ir transkriptikos.

Atsisiųskite „Proteomics vs Transcriptomics“ PDF

Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatos pastaboje. Atsisiųskite PDF versiją čia: Proteomikos ir transkriptikos skirtumai

Nuoroda:

1.Horganas, Richardas P ir Louise C Kenny. „Ominės technologijos: genomika, transkriptika, proteomika ir metabolomika“. Akušerė ir ginekologė, „Blackwell Publishing Inc“, 2011 m. Liepos 18 d. Galima rasti čia  
2.Gravesas, Paulius R. ir Timothy A. J. Haysteadas. „Molekulinio biologo proteomikos vadovas“. Mikrobiologijos ir molekulinės biologijos apžvalgos, Amerikos mikrobiologijos draugija, 2002 m. Kovo mėn. Galima rasti čia
3.Lowe, Rohanas ir kt. „Transkriptikos technologijos“. PLoS Kompiuterinė biologija, Viešoji mokslo biblioteka, 2017 m. Gegužė. Galima rasti čia  

Vaizdo mandagumas:

1. „Proteomics “„ Xxl7441 “anglų kalba„ Wikibooks “- perkelta iš„ en.wikibooks “į„ Commons “., („ Public Domain “) per„ Commons Wikimedia “.
2.Mikropaveikslas ir sekos sudarymo srauto elementas “Thomas Shafee - Savas darbas, (CC BY 4.0) per„ Commons Wikimedia “