Skirtumas tarp shRNR ir siRNR

shRNR prieš siRNR

RNR trukdžių (RNR) proceso metu tikslinio geno ekspresija numušama labai specifiškai ir selektyviai. RNR yra natūralus procesas ir apima mažas trukdančias RNR (siRNR) ir trumpų plaukų smeigtukų RNR (shRNR) bei bifunkcines shRNR. Šiuo metu RNR yra plačiai naudojama kaip individualizuotos vėžio terapijos priemonė. RNRi panaudojimas iš esmės atliekamas su chemiškai susintetintomis dvigrančiomis siRNR ir vektorinėmis SHRNR molekulėmis. Nors šių dviejų molekulių funkcinės savybės yra panašios, jos skiriasi savo struktūra; taigi, skiriasi ir šių dviejų molekulių veikimo molekuliniai mechanizmai, RNR keliai ir atsitiktinis poveikis.

shRNR

shRNR yra mažos RNR molekulės seka, kuri priveržia griežtą plaukų segtuką, kurį galima panaudoti nutildyti tikslinio geno ekspresiją RNR metu. ShRNR ekspresija pasiekiama vektoriu, kuris gali būti virusas arba bakterija, arba perduodant plazmides. Jie sintetinami ląstelių branduolyje ir pernešami į citoplazmą tolimesniems procesams. Šios molekulės turi panašius miRNR brendimo kelius; Taigi miRNR sintezė suteikė pagrindą suprasti shRNR sintezę. Bet kuri RNR polimerazė II arba III gali perrašyti shRNR per RNR polimerazės II arba III promotorius. ShRNR naudojimo pranašumas yra tas, kad jie turi santykinai mažą irimo ir apykaitos greitį. Trūkumas yra tas, kad jam reikia išraiškos vektoriaus, kuris gali sukelti tam tikrų saugos problemų.

siRNR

siRNR yra dvigubos grandinės RNR molekulės, sudarytos iš 20–25 bazių porų. Jie naudojami genų slopinimui, nutildant bet kurį geną, turinčią komplementarią nukleotidų seką RNAi kelyje. Genų numušimas transfekuojant siRNR dažnai nesėkmingas dėl trumpalaikio poveikio; ypač greitai dalijamosiose ląstelėse ir slopinimas trunka ne ilgiau. Norėdami išspręsti šią problemą, siRNR yra modifikuota, įvedant trumpą plaukų segtuko struktūrą. Ši modifikuota molekulė tada vadinama shRNR. shRNR turėtų būti paversta siRNR, naudojant Dicer, kad ji normaliai funkcionuotų.

Kuo skiriasi shRNR nuo siRNR?

• Skirtingai nuo siRNR, shRNR turi papildomą plaukų segtuko struktūrą. shRNR yra modifikuota siRNR versija.

• shRNR reikia ekspresijos vektoriaus, tuo tarpu siRNR to nereikia.

• shRNR gali būti naudojama ilgalaikiam genų numušimui, o siRNR - tik trumpalaikiam genų numušimui..

• Skirtingai nuo siRNR geno slopinimo, shRNR slopinimas yra ilgalaikis ir, jei jis įterpiamas per atitinkamą virusinį vektorių, jis gali sukelti nuolatinį genų nutildymą..

• Norint konvertuoti shRNR atgal į siRNR molekulę, norint atlikti įprastas jos funkcijas, reikalingas dikteris.