Skirtumas tarp RT-PGR ir QPCR

Atvirkštinės transkripcijos polimerazės grandininė reakcija (RT-PGR)

RT-PGR palyginti su QPCR

Pažanga biotechnologijų srityje leido atrasti keletą būdų, kaip per daugelį metų patenkinti organų transplantacijos poreikius. Anksčiau asmuo, kuris savanoriškai paaukojo bet kurį organą iškart po mirties pacientui, kuriam reikalinga, galėjo tik pradėti transplantacijos operaciją. Nuolatiniai biologų tyrimai ir tyrimai lemia kamieninių ląstelių atradimą.

Kamieninės ląstelės reiškia tas, kurios yra paimtos iš embriono DNR, ir tai bus ląstelių, kurios iš esmės būtų organo, iš kurio buvo paimta DNR, klonas, regeneracijos šaltinis. Žmogaus teisių gynėjai siekia, kad tokios procedūros būtų sustabdytos, tačiau sėkmingos operacijos iš tikrųjų įrodė kamieninių ląstelių vystymosi organų transplantacijose veiksmingumą..

Tačiau norint įvertinti ir pilnai suprasti kamienines ląsteles, reikia susipažinti su skirtingais terminais, susijusiais su šiuo mokslo atradimu. Kamieninių ląstelių auginimas susijęs su DNR ir jos kodavimu. Taigi studentams ar visiems, besidomintiems šia sritimi, būtina atskirti RT-PGR ir qPCR.

Atvirkštinės transkripcijos polimerazės grandininė reakcija (RT-PGR) yra vienas iš daugelio polimerazės grandininės reakcijos variantų, arba PGR. Ši laboratorinė technika yra plačiai naudojama molekulinėje biologijoje tam, kad mokslininkai pagamintų daug tam tikros DNR sekos kopijų per procesą, kuris vadinamas „amplifikacija“. Skirtumas tarp RT-PGR ir tradicinio PGR yra tas, kad RNR pirmiausia transkriptuojama atvirkščiai į savo DNR komplementą, kuriame naudojama atvirkštinė transkriptazė. Nauja papildoma DNR, kurioje yra atvirkštinė transkripcija, bus amplifikuota naudojant tradicinę PGR arba realaus laiko PGR.

Daugelis studentų, studijuojančių šį procesą, dažnai daro klaidą keisdamiesi atvirkštinės transkripcijos PGR ir realaus laiko PGR, nes abu šie principai yra sutrumpinti. Norėdami išvengti painiavos, biologai realaus laiko PGR pažymi kaip kiekybinę realaus laiko PGR arba qPCR.

QPCR labai skiriasi nuo RT-PGR, nes qPCR yra atsakingas už amplifikacijos matavimą, kai ji įvyksta. Galima sakyti, kad RT-PGR pradeda amplifikacijos procesą, o qPCR matuoja jį, kai vyksta procedūra.

Kiekybinis realaus laiko PGR

QPCR iš tikrųjų sukėlė revoliuciją tradiciniame vienpusiame metode, kai reikia nustatyti DNR ir RNR, nes taikant qPCR metodą biologams galima nustatyti pradinę branduolio rūgšties koncentraciją dar nepastebėjus reakcijos rezultatų ir užrašytas žemyn.

QPCR, kuris dabar laikomas galingiausiu ir jautriausiu genetinių tyrimų analizės metodu, taikymas žymiai išsiplėtė. Šiuo metu ji užsiima kiekybine genų ekspresijos analize, genotipų nustatymu, patogeno nustatymu ir SNP analize bei RNR trukdžių matavimais..

QPCR dažnai derinamas su atvirkštinės transkripcijos procesu, siekiant kiekybiškai įvertinti pasiuntinių RNR ir mikroRNR, esančius audinių ląstelėse, stebėtose ir eksperimentuojant. Tada gaunamas dar vienas akivaizdus skirtumas tarp šių dviejų: RT-PGR gali būti naudojamas amplifikacijos procesui, tačiau kiekybinio įvertinimo tikslais jį reikia sulieti su qPCR..

Taip pat žinoma, kad QPCR yra kiekybiškesnis, nes duomenys gali būti renkami progresuojant PGR eksponentinio augimo (log) fazei. Biologai pažymi, kad PGR šalutinio produkto kiekis yra tiesiogiai proporcingas šablono nukleorūgšties kiekiui, kuris bus išmatuotas per qPCR.

Kita vertus, RT-PGR toli gražu nėra kiekybinis, nes pastebėjus amplifikuotos juostos intensyvumą ant gelio, laikantis nustatyto koncentracijos standarto, gali susidaryti „pusiau kiekybiniai“ padariniai.

Santrauka:

1.QPCR ir RT-PCR yra abu terminai, naudojami biotechnologijose ir naudojami kelių DNR kopijų gamybai.
2.RT-PGR naudojamas atvirkštinės DNR kodo transkripcijos amplifikacijai; QPCR matuoja amplifikaciją.
3.RT-PGR yra skirtas amplifikacijai, o qPCR - kiekybiniam įvertinimui.
4.QPCR yra kiekybinio pobūdžio, o RT-PGR - ne.