Skirtumas tarp SDS PAGE ir gelinės elektroforezės

SDS PAGE vs gelio elektroforezė

Elektroforezė gali būti naudojama norint nustatyti objekto masę, paprastai baltymus ir dezoksiribonukleorūgštį (DNR). DNR grandinė, įvesta į chemines medžiagas, gali pagreitinti arba sulėtinti informacijos procesą. Žinomos masės DNR žymekliai naudojami apytiksliai nustatyti objektų, einančių po elektroforezės, dydį. Elektroforezė greičiausiai yra labiausiai naudojama priemonė molekuliniams biologams ir biochemikams.

Yra du elektroforezės tipai, kurie dažniausiai naudojami šiame procese. Tai yra natrio dodecilsulfato poliakrilamido gelio elektroforezė (SDS-PAGE) ir natūrali gelio elektroforezė..

SDS-PAGE yra neselektyvus gelinės elektroforezės metodas, naudojamas tokiose srityse kaip: biochemija, teismo ekspertizė, biologija ir genetika, siekiant atskirti baltymus nuo jų elektroforetinio judėjimo. SDS yra anijoninė paviršiaus aktyvioji medžiaga, kuri gali būti naudojama padėti lizuoti ląsteles ekstrahuojant DNR ir atskirti baltymus SDS-PAGE. Elektroforezės metu baltymų mišinys pirmiausia suskystinamas SDS tirpale. Tada, norint pašalinti disulfidinius ryšius, baltymai būtų linijiški, naudojama medžiaga, vadinama merkaptoeetanoliu. Tada pradedama elektroforezė. Rezultatai duos du likučius molekulių, iš kurių vienas yra SDS-PAGE.

SDS-PAGE nebuvimas nėra problema, nes gelinė elektroforezė vis dar gali būti atliekama tik tuo atveju, jei baltymai nepraranda visos savo antrinės ir tretinės struktūros ir neatsidaro į paprastai tiesius strypus..

Tuo tarpu vietinėje gelio elektroforezėje gelis naudojamas kaip antikonvekcinė terpė. Paprastai jis naudojamas biologinėms makromolekulėms, tokioms kaip DNR, ribonukleino rūgštis (RNR) ir baltymams atskirti. Jis taip pat gali būti naudojamas nanodalelėms atskirti.

Natūralioje gelinėje elektroforezėje naudojami du pagrindiniai geliai, būtent:

Agarozės gelis, naudojamas didesnėms molekulėms. Šis gelis neidentifikuoja mažų skirtumų tarp dviejų molekulinių juostų. Jis taip pat naudojamas tik DNR atskyrimui. Agarozės gelis vizualizuojamas naudojant etidžio bromido mišinį.

Poliakrilamido gelis, naudojamas mažesnėms molekulėms. Šis gelis nustato skirtumus tarp molekulinių juostų. Be DNR, jis taip pat gali atskirti baltymus.

Santrauka:

1.SDS-PAGE yra neselektyvus gelinės elektroforezės metodas, naudojamas tokiose srityse kaip: biochemija, teismo ekspertizė, biologija ir genetika, siekiant atskirti baltymus nuo jų elektroforezinio judrumo, tuo tarpu gelinė elektroforezė paprastai naudojama biologinėms makromolekulėms, tokioms kaip DNR, atskirti, ribonukleino rūgštis (RNR) ir baltymai. Jis taip pat gali būti naudojamas nanodalelėms atskirti.

2. Natūrali gelio elektroforezė yra dviejų tipų, būtent: agarozės gelis ir poliakrilamido gelis.