Skirtumas tarp SDS ir vietinio puslapio

Pagrindinis skirtumas - SDS puslapis palyginti su vietiniu Puslapis
 

SDS ir natūralusis puslapis yra dviejų tipų poliakrilamido gelio elektroforezės metodai, naudojami molekulinėje biologijoje. pagrindinis skirtumas tarp SDS ir „Native Page“ yra naudojamas poliakrilamido gelio tipas. Todėl SDS puslapyje naudojamas denatūravimo gelis, todėl molekulės yra atskirtos pagal jų molekulinę masę. Gimtajame puslapyje, priešingai, naudojami denatūruojantys geliai. Todėl molekulės yra atskirtos atsižvelgiant į jų dydį, krūvį ir formą.

Poliakrilamido gelio elektroforezės metu (puslapis) naudojamas gelis, pagamintas polimerizuojant akrilamido monomerus metileno bisakrilamidu. Poliakrilamidas yra tvirtesnis ir labiau atsparus šilumai nei agarozė. Poliakrilamido geliai turi mažesnį porų dydį, kuris leidžia efektyviai atskirti baltymus. Yra du pagrindiniai puslapio sąrankos tipai, būtent SDL puslapis ir Gimtasis puslapis. SDS puslapis arba Natrio-dodecilsulfato poliakrilamido gelio elektroforezė atskiria baltymus pagal jų molekulinį svorį. Denaturuojantys geliai naudojami SDS puslapyje. Natūralus puslapis naudoja nedenaturuojančius gelius ir atskiria baltymus pagal jų dydį, krūvį ir formą (3D formacija).

TURINYS

1. Apžvalga ir svarbiausias skirtumas
2. Kas yra SDS puslapis
3. Kas yra vietinis puslapis
4. SDS ir gimtojo puslapio panašumai
5. Lyginimas iš šono - lentelės formos SDS puslapis prieš pradinį puslapį
6. Santrauka

Kas yra SDS puslapis?

SDS puslapis yra labiausiai paplitęs elektroforezės metodas, naudojamas baltymams atskirti pagal jų molekulinę masę. Gelis gaminamas pridedant SDS (natrio dodecilsulfato), kuris yra skalbiklis. SDS protezus skaido į monomerus. SDS yra anijoninis ploviklis. Todėl baltymai gauna gryną neigiamą krūvį plačiame pH intervale. Kai baltymų molekulėms perduodamas grynasis neigiamas krūvis, dėl krūvio kitimo, sudėtingos struktūros suskaidomos. Dėl neigiamo krūvio baltymai pritraukia teigiamą pabaigą. Taigi mažesnės molekulinės masės molekulės greičiau eina ant gelio matricos ir gali būti stebimos arti anodo, tuo tarpu didesnės molekulinės masės baltymai stebimi arčiau šulinių..

01 paveikslas: SDS puslapis

SDS prisijungimas prie polipeptido grandinės yra proporcingas jo santykinei molekulinei masei. Todėl molekulinę masę taip pat galima nustatyti naudojant SDS. SDS Page geliai dažomi bromfenolio mėlyna spalva. SDS puslapio taikymo sritis yra didesnė, kai ją galima panaudoti santykinei molekulinei masei įvertinti ir santykiniam baltymų gausumui baltymų mišinyje nustatyti. SDS puslapis taip pat gali būti naudojamas baltymų pasiskirstymui baltymų mišinyje nustatyti. SDS puslapis taip pat naudojamas baltymams išvalyti ir įvertinti. Jis naudojamas kaip preliminari Vakarų balinimo ir hibridizacijos procedūra, kuri savo ruožtu naudojama baltymų kartografavimui ir identifikavimui.

Kas yra vietinis puslapis?

Natūralaus poliakrilamido gelio elektroforezė („Native Page“) naudoja nedenaturuojantį gelį. Todėl SDS ar bet kuris kitas denatūruojantis agentas nėra pridedamas prie gelio matricos. Gimtajame puslapyje baltymai atsiskiriami atsižvelgiant į krūvį ir baltymo dydį. Todėl baltymo mobilumas priklauso nuo krūvio ir baltymo dydžio.

Baltymų krūvis priklauso nuo aminorūgščių šoninių grandinių. Jei šoninės grandinės yra neigiamai įkrautos, baltymai gaus bendrą neigiamą krūvį ir atvirkščiai. Baltymai išlaiko 3D formaciją dėl vykstančio lankstymo. Sulenkimas atsiranda dėl kelių rūšių baltymų jungčių, tokių kaip disulfidiniai ryšiai, hidrofobinė sąveika ir vandenilio jungtys. Taigi, jei natūralusis puslapis nešamas esant neutraliam pH, baltymai bus atskirti pagal baltymo molekulinę formą. Todėl „Native Page“ gali būti naudojamas kaip jautri technika, leidžianti nustatyti baltymo krūvį ar struktūrą.

Pagrindinis vietinio puslapio pranašumas yra tas, kad Puslapio analizei naudojami baltymai gali būti atgauti pradinėje būsenoje atlikus Puslapio analizę, nes baltymai proceso metu nesutrikdomi. Gimtasis puslapis yra gana didelis pralaidumo būdas, padidėja baltymo stabilumas.

02 pav. Pradinis puslapis

Užbaigus gelio paleidimą, „Native Page“ gelį galima apžiūrėti dažant bromfenolio mėlynu ar kitu tinkamu dažymo reagentu. Gimtojo puslapio naudojimas apima rūgščių baltymų, įskaitant glikoproteinus, tokius kaip žmogaus rekombinantinis eritropoetinas, atskyrimą arba baltymų, esančių galvijų serumo albuminuose (BSA), identifikavimą..

Kokie yra SDS ir gimtojo puslapio panašumai?

• SDS ir „Native Page“ sistemose kaip gelio matrica naudojamas poliakrilamido gelis.
• Abu yra naudojami baltymams atskirti ir identifikuoti.
• Abiem junginiams atskirti naudojamas elektroforezinis judrumas.
• Abu juos galima atlikti vertikaliai arba horizontaliai (dažniausiai tai daroma kaip vertikalūs puslapio nustatymai, nes eigos ilgis yra didesnis).
• Abiejų metodų veikimui reikalingas elektroforezės aparatas, apimantis gelio baką, šukas, maitinimo šaltinį.
• Gelis gali būti vizualizuojamas dažymo būdais abiem būdais.

Kuo skiriasi SDS puslapis ir vietinis puslapis??

SDS puslapis prieš pradinį puslapį
SDS puslapis arba natrio-dodecilsulfato puslapis atskiria baltymus pagal jų molekulinę masę ir naudoja denatūruojantį gelį..	Natūralus puslapis naudoja nedenaturuojančius gelius ir atskiria baltymus pagal jų dydį, krūvį ir formą (3D formacija).
Gelio rūšis
SDS puslapyje naudojamas denatūravimo gelis.	Gimtajame puslapyje naudojamas nedenaturuojantis gelis.
SDL buvimas
SDS yra kaip skalbiklis, kuris SDS puslapyje pateikia neigiamą pavyzdį.	Pagrindiniame puslapyje SDS nėra.
Atskyrimo pagrindas
Baltymų atskyrimas priklauso nuo baltymo molekulinės masės SDS puslapyje.	Atskyrimas priklauso nuo baltymo molekulės dydžio ir formos gimtajame puslapyje.
Baltymo stabilumas
SDS puslapyje baltymų stabilumas žemas.	Gimtajame puslapyje baltymų stabilumas yra didelis.
Originaliojo baltymo atkūrimas
Neįmanoma, nes tai denatūruota SDS puslapyje.	Galima gimtajame puslapyje.

Santrauka - SDS puslapis palyginti su vietiniu Puslapis

SDS puslapis ir „Native Page“ yra dviejų tipų poliakrilamido gelio elektroforezės metodai, naudojami baltymams atskirti. SDS puslapis yra apdorojamas plovikliu, vadinamu SDS. SDS baltymui suteikia bendrą neigiamą krūvį, kuris lemia baltymo denatūraciją. Todėl baltymai yra atskirti atsižvelgiant į jų molekulinę masę. Gimtojo puslapio technika nenaudoja jokio denatūravimo agento. Taigi baltymai yra atskirti pagal jų dydį arba formą. Tai yra skirtumas tarp SDS ir savojo puslapio.

Nuoroda:

1. „Poliakrilamido gelio elektroforezės principas ir metodas (SDS-PAGE).“ Poliakrilamido gelio elektroforezės principas ir metodas (SDS-PAGE) MBL Life Sience -ASIA-. Galima rasti čia
2. „Vietiniai želė“. Aljanso baltymų laboratorijos | Biofizinio apibūdinimo paslaugos. Galima rasti čia  

Vaizdo mandagumas:

1.'SDS-PAGE elektroforezė'By Bensaccount angliškoje Vikipedijoje (CC BY 3.0) per „Commons Wikimedia“  
2. „Įdėkite mėginį į poliakrilamido gelio elektroforezės šulinį“ Blaz Nemec iš Liublianos (Slovėnija) (CC BY-SA 2.0) per „Commons Wikimedia“